Viajero Frecuente

Pues, a partir de ahora, he vuelto 50,000 millas para este proyecto. Desde marzo. Es cómico; reí cuando Becky me avisó que el trabajo requeriría muchos viajes…

Oh, por cierto, estoy en Montserrat. La volcánica isla caribeña que inspiró a Jimmy Buffet para escribir su canción clásica ‘Volcano’. Míralo a YouTube.

Me subí a otro pequeño avión y aterricé en otra pequeña isla.

Me subí a otro pequeño avión y aterricé en otra pequeña isla.

Estoy ayudando el Instituto Waitt con algunos estudios ecológicos, y en retorno, espero ser capaz de conseguir algunas muestras para mi proyecto. Pero la primera vez que oí hablar de esto fue hace 7 días y sólo ahora empiezo sentirme a casa en mi alojamiento. But I found out about this just 7 days ago and am only just settling in to my accommodations. ¡Tan divertido!

Because why not

¿Por qué no?

Antigua

¡Merci Beaucoup!

Aunque a nosotros generalmente nos gusta anunciar todos los detalles divertidos de nuestro projecto, hacer trabajo de campo internacional es dificil. Montañas de papeleo y preparación se exigen para nuestros viajes (gran parte de ella a menudo estresante y de última hora), y cuando llegamos, por lo general no conocemos muy bien los corales locales, no conocemos el idioma tan bien como creíamos, ni conocemos el área en absoluto. Estamos aprendiendo a medida que vamos sobre todas las mejores maneras de hacer nuestros viajes sin problemas.

Pero por ahora, como yo estoy sentado en el aeropuerto de Paris de camino a casa, me gustaria dar un grito por toda la gente que ha ayudado a hacer este particular viaje. Uno de los primeros contactos que hizo Jerome en la isla fue con Le Club de Plongee Suwan Macha – una organización de buzos que trabaja como una cooperativa, comprando y manteniendo recursos que son compartidos por los miembros en un muy asequible precio. Este sistema funciono de forma fenomenal para nosotros para hacer inmersiones personalizados y parece que es un impresionante montaje para buceo científico en general. Incluso sacamos unos pocos tanques de aire para algunos de nuestros ‘trabajos de laboratorio’, no relacionados a buceo. Después de juntarnos en el Club, el presidente de funciones, Pierre Grisoni, ofreció su tiempo para conducir el bote y rellenar los tanques para nosotros para todas los inmersiones que hicimos en la costa oeste de la Isla. Esas inmersiones fueron esencialmente a nuestras colecciones y formaron el núcleo de nuestro viaje! Merci beaucoup à Pierre y el resto del club!

Thanks, Pierre!

¡Gracias, Pierre y Suwan Macha!

Otro contacto importante fue el Dr. Jean-Pascal Quod, presidente de Reef Check France [Monitoreo Arrecifal de Francia] y gerente de Pareto Econsult. Jean-Pascal y el club de buceo SUBEST estuvieron instrumentales en nuestras colecciones en el lado Este de la isla, y nos mostraron algunas arrecifes realmente grandiosos allí.

Tal vez la entidad local más importante fue La Reserva Natural Marina de La Réunion (RNMR), que nos proporcionó permisos para colecciones locales y preparó nuestro permisos de exportación de CITES. Tratar con este papeleo es a menudo la parte más difícil de nuestro trabajo, y ser capaz de trabajar con la autoridad local de gestión es esencial para nuestro proyecto.

Muchas otras personas han sido de gran ayuda en este viaje en particular. Para empezar, gorroneé un viaje hacia y desde el aeropuerto de Portland con mis padres, que es excelente. También dejé mi coche con ellos y tuve un lote más ayuda de ellos antes de salir. Pienso que la madre de Amelia también trajo a ella y a Jerome al aeropuerto, después de coser rápidamente juntos el bolsillo de peso de mi chaleco de buceo para mí. Ummm, ¡impresionante! ! Y entonces hay la madre de Jerome, que en múltiples ocasiones nos acogió para cenas pendientes mientras estábamos en la Réunion. ¡Todo en la vida es más fácil con padres como estos!

Les parents

Les parents McMinds: merci por todo lo que hacen

También conocimos a muchos de los amigos y familiares de Jerome mientras estábamos allí, varios de ellos nos proporcionó comida deliciosa, también. ¡Gracias a todos ustedes por mostrarnos su isla y hacer el viaje genial!

Desde que empezamos a planificar el viaje, ha habido una persona que hizo los contactos adecuados, habló el lenguaje adecuado, y trabajó duro para conseguir todo de los permisos y hacer el papeleo en francés: el Dr. Jerome Payet. Además de organización anteriormente al viaje, también sirvió como nuestro guía, facilitador, traductor, y codirector durante todo el viaje. He trabajado con Jerome mucho en los varios años pasados, y ha sido un parte del laboratorio integral para un poco más de mi, pero trabajar en este proyecto en particular era generoso por su parte. Este viaje se produjo en un momento especial para Jerome, también, por que él se está transladando a trabajar con un laboratorio diferente en OSU. El trabajo que él hizo es por lo tanto muy apreciado. Gracias – ¡¡te extrañaremos!!

Au revoir, Jerome

Au revoir, Jerome

Introducción a la estrategia de muestreo

El muestreo está aumentado aquí en Reunion, y las casillas de verificación están llenándose junto a los nombres de corales. En los últimos tres días, hemos recogido muestras de 27 corales, representando 22 especies de 16 géneros, 11 famílias y 2 clases. Ya que el proceso material de la toma de una muestra supone simplemente rozar una jeringa contra ello y partir un trozo diminuto, nuestro número no puede ser realmente muy alto. Sin embargo, hay varias cosas que hacen que el proceso tome más tiempo que la teoría predeciría. Como Amelia mencionó en la última entrada, una cosa que nos ralentiza es el ambiente. Habíamos descubierto antes que trabajar en agua poco profunda no es fácil. En la laguna aquí en Reunion, el agua es a menudo tan poco profunda que estamos intentando encontrar corales vivos en agua a la profundidad de un tobillo, entonces tener que encontrar una forma de tumbarse para examinarlas sin aplastar el arrecife o sentarse en un pez escorpión venenoso. En otros lugares, el agua está a la altura de la cintura, y las olas rompiendo en la cresta continua en el arrecife de atrás, chapoteándonos entre los corales afilados y los corales de fuego punzantes, y haciendo muy difícil permanecer suficientemente estable para tomar las fotos y muestrear. Además, el invierno está aquí, y el agua está “fría”. 76 grados Fahrenheit parecen calientes al principio, pero después de aproximadamente 4 horas de estar submergido en ella, el agua aún socava todo el calor de nuestro cuerpo. ¡Nos estamos convirtiendo en frío y quemado por el sol, y estamos recibiendo una paliza!

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Pero, si ese fuera el único problema, yo diría que ¡sólo tendríamos que aguantar y hacer el trabajo! Pero otro, mayor problema es que tenemos que encontrar los corales. No sólo cualquiera, sino una lista relativamente específica de tipos de corales. Sólo tenemos planeado coger un pequeño número de muestras de cada tipo mientras estamos aquí, y preferíamos no cogerlas todas del mismo lugar en el mismo tiempo. Ante mencioné que factores confusos pueden hacer difícil determinar que variable es responsable en una tendencia dada. Si todo lo que encontráramos en el Día 1 fueran Porites y Acropora, e inmediatamente cogiéramos todas las muestras del viaje de aquellas especies, habríamos confundido nuestra variable de especies con las de tiempo y de lugar. Más tarde, si cogiéramos todas las muestras de Fungia en un solo día diferente, sería difícil confiar que las diferencias en los microbios entre nuestras muestras de Porites y Fungia fueran realmente atribuibles a la especificidad del huésped. Una explicación alternativa igualmente buena sería que los microbios en los corales del Día 1 fueran diferentes que los microbios en los corales del Día 5, no importa cuáles especies muestreáramos en cada día. Esto es probablemente cierto para muchos microbios debido a diferencias en la preponderancia de la enfermedad, la altura de la marea, la dirección de la corriente, el nivel de la luz, etc. Para confiar en que las diferencias son debidas a las especies de coral, necesitamos tener un plan de muestreo claro. Una solución es encontrar y muestrear replicas de muchas especies de corales diferentes en el mismo día. Las diferencias entre estas muestras serían más confiablemente atribuibles a colonias individuales y, a través de la replicación, a especies de coral. Así que hacemos nuestro mejor para encontrar localizaciones que tengan altos niveles de diversidad. Arrecifes de alta diversidad eran fáciles de encontrar en Lizard Island y KAUST e ¡hicieron nuestro muestreo ir mejor allí!

No tenemos problemas en encontrar Porites (masiva) y Acropora (ramificado)...

No tenemos problemas en encontrar Porites (masiva) y Acropora (ramificado)…

Este Fungia, sin embargo, es solo lo único que habíamos encontrado, hasta ahora.

Los primeros varios días que estuvimos en Reunion, dedicamos mucho tiempo a explorar la laguna en la calle justo debajo de nuestra casa alquilada. Elegimos la casa esperando que la mayoría de nuestro muestreo sería justamente un paseo y nado corto de distancia. Sin embargo, no encontrábamos mucho en aquellos arrecifes. De las aproximadas 16 familias de coral que esperábamos encontrar aquí, sólo 2 fueron comunes, y encontramos sólo 5 en total allí. Así después de un fin de semana de exploración de la isla por diversión (escapándo de los ojos críticos de las grandes masas de la playa), comenzamos nuestro muestreo en la laguna de Trou d’Eau, un paseo corto por coche al sur de nosotros. Los arrecifes allí eran, si algo, menos abundantes y diversos que los de aquí. Obtuvimos muestras de 5 familias, y replicación de sólo 2 de esas familias. Así al día siguiente fuimos incluso más al sur, a Saint-Leu, para ver si nuestra suerte sería mejor. En realidad, encontramos un arrecife que tenía mucha más cobertura y mucha más diversidad que aquellas al norte. Recogimos muestras de 8 familias, ¡5 de las cuales eran nuevas! Aún, con un total de 10 familias, todavía perdíamos varias que habían sido muy comunes y notorias en muchos otros arrecifes del Indo-Pacífico que he muestreado. Así ayer decidimos intentar un ambiente diferente y desafiar por buceo las arrecifes frontales infestados de tiburones. El día fue fabuloso – me gusta absolutamente el sentimiento de estar en un barco en los trópicos, y el sentimiento de respirar aire claro y fresco a través de un regulador mientras suspendido bajo el agua. Además, el muestreo es mucho más fácil bajo las olas, y no tiende a golpearnos. Pero el arrecife no era muy diverso. Encontramos 5 familias de coral – sólo 1 de ellas nueva.

¡Ahh, amo estar en el agua!

¡Ahh, amo estar en el agua!

Pensé que esto era una Montipora - ¡una inspección más cercana revela que es sólo otra especie de Porites!

Pensé que esto era una Montipora – ¡una inspección más cercana revela que es sola otra especie de Porites!

Escapada de fin de semana

Escapada de fin de semana

Las frías neblinas del volcán

Las frías neblinas del volcán

Mientras el viaje alcanza su punto medio, estamos preparados para ponernos para replicar lo que ya tenemos. Mantendremos nuestros ojos alerta para encontrar las familias de coral perdidas, pero estaríamos relativamente satisfechos con el repertorio actual si concluimos los hallazgos. Hoy, nos dirigimos de nuevo al sur, esta vez buceando en el arrecife frontal, donde esperamos encontrar una bonita combinación de muestreo fácil y corales diversos.

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Encontrar la luna y conocer Tiki

Habíamos pasado el fin de semana con la familia de Jerome y después de una noche de comida y risas estábamos listos para explorar la isla. Réunion tiene muchos diferentes microclimas con paisajes que se extienden desde bosques áridos a playas tropicales. Sobre nuestro camino al Volcán Piton de la Fournaise reflexionamos sobre cómo estos diferentes microclimas nos recordó una mezcla de lugares a través del mundo. ¡Incluso encontramos la luna!

Montaña o la luna?

Montaña o la luna?

Piton de la Fournaise es un volcán escudo y es uno de los volcanes más activos del mundo. Tienes alrededor 530,000 anos y 2,631 metros de altitud. Pitón de la Fournaise es uno de dos volcanes, la otra es Pitón des Neiges, que forman Reunión. Hasta hace pocas semanas, la erupción más reciente fue en 1986. Debido a su actividad, los senderos que circundan su cima estaban cerrados, pero todavía fueron capaces de obtener una vista impresionante de la misma!

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¡Piton de la Fournaise!

Por supuesto, ¡no podríamos haber hecho alguna de estas sin nuestro impresionante sombreros acompañados!

La mamá de Jerome nos equipa con sombreros acompañados para protegernos del sol.

La mamá de Jerome nos equipa con sombreros acompañados para protegernos del sol.

Ahora que el fin de semana ha terminado es el momento de ponerse a trabajar. Lunes llegó muy temprano con el canto de los pájaros y el olor de la ciencia en el aire! Como todos los buenos científicos, teníamos nuestro café ritual de la mañana y luego se fuimos al campo. Pasar la mayor parte del día muestreando podíamos ver la mayoría de la laguna en Saint-Gilles. En la laguna solo pudimos encontrar cinco clados diferentes de coral, una gran cantidad de pepinos de mar y cero tiburones.

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¡Una instantánea de los corales que recolectamos! (Montipora sp., Porites cylindrica y Porites lichen)

Lo más importante que debo decir sobre el Lunes es esto: cinturones de peso. Aunque estábamos en una laguna poco profunda nuestra pesa boyante seguía empujándonos hacia arriba, haciendo difícil – pero no imposible – muestrear. Desde la orilla estoy seguro que nos veíamos como dos nadadores sincronizados pobremente coordinados con nuestros pies agitándose en el aire mientras tratábamos de estar abajo.

Hoy, nos subimos al auto y fuimos a una sección distinta de la isla esperanzados en encontrar un arrecife con mas biodiversidad. Encontramos un tesoro y se saludamos por hermosos arrecifes en agua cristalina. Pero hubo una trampa: fuertes corrientes (las favoritas de todos). Las corrientes rápidamente nos introdujeron a Ryan y a mi en los corales de fuego de los alrededores y para el fin de la jornada del campo debo decir que todos nos convertimos en buenos amigos.

Afortunadamente, habíamos traído Tiki con nosotros así que no fuimos mordazmente lastimados. Tiki es el amuleto de la buena suerte del laboratorio Vega-Thurber y ha estado en casi todos los viajes de campo al que el laboratorio ha ido. Dicho eso, Tiki ha viajado mucho y ha padado muchos días en el mar (la conversión de su pelo negro a rubio es una prueba). Permitiré que Tiki se presente a sí mismo:

https://www.flickr.com/photos/131967103@N02/20690925201/in/album-72157651381609701/

Así amigos, ¡eso concluye los días pasados en Reunión!

Bienvenue à la Réunion!

¡Hola chicos! Me llamo Amelia Foster. Actualmente soy estudiante no licenciado aunque pronto me graduaré (yeah!) Antes del final de este verano, de hecho, habré terminado mis asignaturas principales de microbiología y de estudios internacionales. Comencé un voluntariado en el laboratorio de Becky como estudiante de segundo año en 2012. Bajo su tutoría he aprendido importantes técnicas de biología molecular, asociadas con la ecología de arrecifes de coral. Recientemente, me han dado la oportunidad de aprender técnicas de trabajo de campo con Ryan y Jerome en la Isla Reunión, Francia.

Nuestro patrón de vuelo de Oregon a Réunion

Nuestro patrón de vuelo de Oregon a Réunion

Después de más de 30 horas de vuelo, una cantidad exagerada de bebés llorando y un lote de pan y queso, llegamos a Reunión justo cuando el sol estaba saliendo por encima del agua. Originalmente llamado Bourbon, Reunión es una sección francesa situada en el océano Índico justo al este de Madagascar. Erupciones volcánicas iniciadas hace 5 millones de años formaron la isla que hoy alberga cerca de 850.000 personas. La isla estuvo deshabitada hasta el año 1643 cuando los Franceses enviaron al exilio doce convictos allí. A mediados del siglo XVII la isla fue más colonizada. Los colonos reclutaron una gran cantidad de esclavos para mano de obra, de África, Madagascar, la India y Tamil hasta el año 1848, lo que marcó la abolición de la esclavitud. Ahora, Reunión tiene una identidad multi-cultural con gente de todas partes del mundo.

Desde que llegamos a la isla sólo hace unos pocos días estuvimos enteramente inmersos (aunque todavía no puedo hablar en absoluto) en francés y hemos empezado haciendo estudios de campo. Desde la casa al mercado y a la playa, mi vida diaria se ha convertido en un juego de charadas. Recogiendo algunas palabras aquí y allá, puedo actualmente encadenar algunas frases que son inaplicables a casi todas las situaciones:

Je ne sais pas et jáime l´pomme et l´chat.  

Ryan lo está haciendo mucho mejor que yo y casi puede mantener una conversación en francés. Pero Jerome, que es de Réunion, sigue siendo nuestro salvador en casi todas las situaciones.

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Pasar el rato con la familia de Jerome

Jerome no sólo nos ha presentado a su familia y sus amigos de la isla pero nos ha dicho del aterrador homme-coq. El homme-coq tiene el cuerpo de una gallina y las piernas de un hombre. Vaga alrededor por la isla, aterrorizando a la gente y robando niños. Así que, debemos tener cuidado.

Pero incluso en la luz del peligroso homme-coq – y no mencionar los tiburones toros – hemos sido capaces de comenzar los paso preliminares en la preparación de nuestro trabajo del campo. Ryan ya me ha dado un curso intensivo en la identificación de corales mientras buscábamos géneros diferentes de coral en la laguna cerca de nuestra casa en Saint Gilles. Y la otra noche ayudamos a Jerome a recoger muestras de agua para después analizar su contenido viral.

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La playa bobine, donde muestreamos actualmente

Hoy, nos coordinamos con tiendas de buceo local para adquirir tanques y empezar muestrear algunos de los corales que identificamos.

El GCMP

Turbinaria stellulata. Familia Dendrophylliidae (“Clad0 II”)[1]

En mi entrada pasada, mencioné que yo estaba continuando el proyecto que empecé el verano pasado en Lizard Island, Australia. Es cierto, pero con mis prisas por publicar una entrada sobre mi viaje actual, me hicieron descuidar algunas actualizaciones importantes. Lo primero y principal: ¡gracias a una beca NSF a través de su programa Dimensions of Biodiversity, nuestro proyecto es oficial y tenemos un nombre! El Proyecto Global del Microbioma Coral, o GCMP. El equipo está compuesto por miembros del Laboratorio Vega Thurber de Oregon State University y el Laboratorio Medina de Penn State University. Además de más dinero y un equipo amplio, los objetivos del proyecto también se han visto ligeramente ampliados. Nuestro objetivo sigue siendo entender cómo los diferente corales han evolucionado para estructurar sus comunidades microbianas, pero, como el nuevo nombre implica, ahora también estudiaremos cómo esas comunidades se diferencian geográficamente en los corales de todo el mundo. Sabemos que los corales que están relacionados entre sí pueden habitar ambientes muy diferentes, por lo que la descripción de los microbios que asocian con sólo un subconjunto de esos ambientes no conseguiría el cuadro completo Por ejemplo, los corales que se ven así:

Porites lobata, Pocillopora verrucosa, Pocillopora …?

se puede encontrar en lugares de tan amplio alcance como las aguas del Pacifico Oriental frías, ricas en nutrientes, y provocadas por afloramiento, las aguas tranquilas de las Islas de la Sociedad en el Pacífico Sur (donde tomé esta foto), y las aguas cristalinas y de manera positiva cálidas del Mar Rojo, desde donde estoy escribiendo esta entrada. .La mayoría de los taxónomos ubican individuos de cada extremo de su rango en la misma especie, pero en algún punto esto es una decisión arbitraria. Hay claras diferencias fisiológicas dentro de las especies de coral que están relacionadas con la geografía. Si transplantas la colonia de Pocillopora damicornis desde Panamá a Arabia Saudita, la elevada temperatura del agua podría casi sin duda causar la blanqueamiento y muerte. Por qué? No sé. Algunos investigadores, tales como los del Laboratorio Meyer de OSU, están tratando de calcular eso por considerar las diferencias genéticas en los corales. Otros sugieren que los corales pueden aclimatarse gradualmente a tales extremos de temperatura. Nosotros pensamos que esas hipótesis son parte de la historia, pero que los microbios que viven con los corales podrían contar otra parte importante. Después de todo, las interacciones con microbios por enfermedad y blanqueamiento son las causas más comunes de muerte de coral. Si comparamos las diferencias en microbios a través de un rango de ambiente de una especie hospedera a las diferencias que se explican por la historia evolutiva del coral, quizá podríamos ser capaces de explicar por qué algunos corales son más tolerantes por variación en el ambiente que otros.

¡Revela sus secretos para mí, oh corales!

Mientras aplazo mi montaña del trabajo de laboratorio en cola, estoy alegremente organizando y editando mis fotos del campo. Hemos fotografiado cada colonia de coral muestreada, esperando usar la colección como una copia de seguridad para los metadatos que hemos colectado simultáneamente. La foto en la parte superior de esta página representa el último coral que muestreamos en este viaje – ¡uno que me hico agitar los puños bajo el agua con entusiasmo! No es una especie particularmente rara, pero Jesse y yo tenía una lista de deseos larga, un corto periodo de tiempo, y un limitado número de arrecifes para explorar. Con el fin de describir los extensos niveles de variación en el microbioma coralino, trataremos de muestrear al menos dos especies de cada familia de coral que nos encontramos, en cada lugar. Después de visitamos varios arrecifes alrededor del mundo, esperamos tener suficientes réplicas de cada familia para describir cómo difieren entre sí. A medida que nuestros tanques de aire lentamente bajan su gas, todavía no habíamos encontrado un representativo de los Dendrophylliidae que tenía simbiontes, aunque ¡sabíamos que existe por aquí en algún lado! Justo cuando lo hube abandonado, descubrí esa roca amarilla. Y sinceramente, la excitación que sentí en ese momento es la razón real por lo que yo hago lo que hago.

El premio es ganado.

El premio es ganado.

¿Dónde dijiste que estuviste?

Registro de expedición. 2 de Marzo de 2015. Universidad Rey Abdullah de Ciencia y tecnología (KAUST), Thuwal, Arabia Saudita.

Después de un agotador viaje de más de 48 horas (incluyendo conducir desde y hacia los aeropuertos, tiempo de vuelo, y escalas), hemos llegado a Arabia Saudita. Me duelen los pies, me duele la espalda, me duele la cabeza, y estoy agotado. En el 2015, nunca debería tomar tanto tiempo llegar realmente a cualquier lugar. Pero nosotros reservamos nuestros vuelos hace sólo una semana; nuestras visas llegaron justo el día antes de que partiéramos. Como resultado del carácter de último minuto de los planes, nuestro itinerario nos hizo parar en San Francisco, Chicago, Frankfurt, y finalmente Jeddah. Hubo tiempo suficiente durante la escala en San Francisco para que David y Justin, los chicos que filman, se encuentren con algunos familiares para cenar afuera del aeropuerto, y tiempo suficiente en Chicago para que todos tomáramos un breve recorrido en auto por la ciudad. Porque yo mismo nunca había estado en Chicago, disfruté a fondo de este tiempo a pesar de la niebla del agotamiento y la ropa maloliente. Pero en este punto, en realidad sólo tengo ganas de una buena noche de sueño.

Registro de expedición. 4 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Pasamos los últimos días recuperándonos de nuestro viaje, conociendo miembros de nuestro laboratorio de acogida, y familiarizándonos con KAUST. Qué lugar fascinante. Una ciudad universitaria entera, construida desde cero en el medio del desierto en sólo un par de años. Los edificios son enormes, monolíticos, incluso monumentales. Estoy viviendo en una casa de estudiantes que me recuerda más a un palacio, con tres pisos, una cama de talla grande y un amplio balcón que me permite disfrutar de la agradable brisa nocturna. Es más que impresionante. Y sin embargo, hay extraños signos de la rápida planificación y construcción. Aceras que no van a ninguna parte, mapas sin etiquetas, pegamento de muy mala calidad que ha llevado a la perdida de los caracteres en la señalización. Si, un lugar extraño.

Registro de expedición. 5 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Hoy fueron nuestros primeros buceos. Qué espectaculares los arrecifes! El tiempo estaba un poco rudo y estuvimos un poco mareados durante los prolongados intentos de anclar, pero una vez que nos metimos al agua, todo se fue. La oleada hacía casi imposible coleccionar muestras, así que por la mayor parte nos conformamos con unos buceos de exploración, recogiendo las vistas y poniéndonos al día sobre los tipos de coral locales. Increíblemente, aunque sólo esperábamos encontrar algo entre 4 y 8 grupos de coral (de un total de más que 21 por todo el mundo), dentro de tres buceos yo había descubierto 12, y espero encontrar al menos uno más. ¡Esos números emulan los que descubrí el año pasado en Australia, y muchos géneros coinciden! ¡Este será un viaje muy productivo!

Registro de expedición. 9 de Marzo de 2015 Algún lugar entre Arabia Saudita y Sudán. Sin tierra a la vista.

Dormimos en el barco en el puerto anoche y salió a los Farasan Banks en la madrugada. Traté de hacer un buceo de muestrear antes del desayuno… y he decidí que en el futuro no trabajaré de nuevo antes de comer. Pero después del primer buceo y un verdadero festín preparado por el tripulación, viajes posteriores bajo la superficie resultó productivo. Visitamos cuatro arrecifes hoy y conseguimos una buen diversidad de muestras de dos de ellos. ¡Empezamos con buen pie!

Registro de expedición. 16 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Después de cinco días de buceo, un día largo explorando Jeddah, y un día preparándonos para los otros tres chicos a salir, ¡estoy agotado! Pasé ayer ponerme al día con trabajo de computadora, y he empezado organizar nuestros metadatos y fotos. Finalmente, tengo algo de tiempo para compartir algunas de las vistas increíbles que hemos estado presenciando en el último par de semanas!


Qué ocupado ha sido este par de semanas. Nunca he estado tan estresado durante la planificación de un viaje – adquirir todos los permisos necesarios para viajar, preparar visas y vuelos y el papeleo – fue una locura! Espero que nunca obtengas un visa para viajar sólo un día antes de tus vuelos. Y ya que Jesse, David, y Justin solamente tenía dos semanas aquí para hacer las cosas, hemos estado empaquetando llenos los días desde entonces. ¡Uf!

Si te estás preguntando porqué estoy en Arabia Saudita, aquí está la respuesta:

Jesse samples at Al Fahal.Aquí hay otra respuesta:

Acropora, Pocillopora, Echinopora.

Oh, y luego está esto:

mind=blown.

El Mar Rojo tiene algunos de los más increíbles arrecifes en el mundo. Rodeado por desierto, hay poca o ninguna escorrentía o la contaminación para arruinar las aguas. Como resultado, la visibilidad es increíble, los colores son alucinante, y los corales son tan felices como podría ser. Lo que es más – son sanos a pesar de que las temperaturas del agua aquí son mucho más altos que los umbrales de blanqueamiento de los arrecifes in cualquier otro lugar en el mundo.

Continuamos el proyecto que empecé el año pasado en Australia, investigando los diferentes microbios que interactúan con corales alrededor del mundo, y decidimos que no podemos generalizar globalmente sobre todos los corales a no ser que incluyéramos los corales de este único medio ambiente. Como puedes ver por mis registros, tuvimos éxito con nuestras colecciones. Ahora, tengo mucho trabajo de laboratorio que hacer – Extracciones de ADN, cultivos de bacterias, y identificaciones de especies de coral usando características esqueléticas microscópicas. ¡Estoy seguro de que será una juerga!

Hola de nuevo (y notas de equipaje para LIRS)

Muy bien, así que fallé miserablemente al mantener este blog mientras estaba en el extranjero. Mala mía. Tú sabes como es – la conexión a Internet está caído por 3-4 días, las entradas escritas anteriormente que tienes listas para salir se suspenden mientras esperas la habilidad para adjuntar fotos, y antes de que lo sepas, te has caído de la furgoneta, tu horario de publicación es irrecuperable, y las distracciones y actividades del trabajo de campo han consumido tu tiempo y atención.

O por lo menos eso es lo que me sucedió a mi.

Afortunadamente para nosotros, esta es una oportunidad para mí de mirar atrás en mi viaje, saboreándolo todo otra vez mientras exploramos digitalmente el arrecife, mientras nos encabezamos hacia los meses del invierno fríos y oscuros del invierno del hemisferio norte. ¡Temblar!

Así que vamos a retomar donde lo dejamos, con un post que escribí pero no publiqué el 3 de agosto, sobre medio camino en mi tiempo en Lizard Island.


Notas de empacar para viajes futuros a Lizard Island:

Cosas para no llevar:

  • Medias. Probablemente piensas ‘¡oh, quizás un par o dos por lo menos!’ pero no. No tragues ningunas medias. Ni zapatos, para esos asuntos. No he llevado ninguno por dos semanas.*
  • Vaqueros. Las noches pueden ser un poco frías, pero la arena se mete en los dobladillos y deja huellas en lugares donde no la quieres. ¡No vale el peso extra!
  • Martillo + cincel. A estos necesito para muestrear mis corales, pero hay abundancia de herramientas en la estación. Desde que estos son realmente pesados y las restricciones de peso para los vuelos a aquí son estrictas, ¡esto fue una gran pérdida de espacio de equipaje!
  • Pan, aparentemente. Por lo menos no tanto como están pensando. Cada uno pide demasiado pan, así que hay una tonelada de sobras en el congelador de “comida gratis”, sobrante de grupos pasados.**

Cosas que podrías olvidar:

  • Chocolate. Y Coca-Cola. Y café. Los pedidos de comida llegan en una barca sólo una vez cada dos semanas, así que si dejas estos fuera de tu pedido, estas frito. Nadie puede ir dos semanas sin café, Coca-Cola, y chocolate.
  • Condimentos. Sí, las personas a menudo también los dejan en el área de comida gratis, pero pueden ser arrebatados rápidamente. ¿Quién quiere una salchicha sin mostaza? Y si puedes traer alguna buena salsa barbacoa americana contigo, serás un éxito en las barbacoas playeras del sábado por la noche. Los “Aussies” no han descifrado éste, se parece… Tampoco han descifrado al “ketchup”. ¿”Salsa de tomate”? ¡Pah!
  • Tu multiherramienta manuable. Sí, debes tener siempre cuidado de ponerla en el equipaje facturado, pero ¡por Dios!, un buen Leatherman es lindo de tener cerca.
  • Un sombrero. Seriamente ¿Por qué no pensaste en traer un sombrero? El sol, ¡se quema!
  • Cables. Lo sé, lo sé, ya revisaste y revisaste por segunda vez para asegurarte que tienes tus cargadores de cámara y de teléfono, tus cables de computadora, y tus adaptadores. Pero aún olvidaste uno; lo garantizo. (La última vez fue el cable de tu ordenador de buceo, y no fuiste capaz de descargar tus reseñas de profundidad y de aire. Estabas muy triste.)
  • Ah, y cosas de ciencia – definitivamente necesitarás más guantes, propinas de pipeta, y bolsitas plásticas estériles (Whirl-Paks) de las que estas pensando. ¿Ese plan que tenías, donde sólo querías 200 muestras? ¡Olvídalo! QUIERES MÁS. ¡Nunca puede tener demasiados muestras!***
  • Y por supuesto, lleva siempre una toalla.****

Ahora, sé que todos ustedes han estado muriendo anticipadamente por las respuestas de identificación de coral de la entrada anterior. Así que aquí estamos:

A. <em>Diploastrea heliopora</em>. Este coral tiene un aspecto muy distintivo, con  <strong title="Estructuras esqueléticas formadas por pólipos de coral individuales">coralitos</strong> acanalados con forma volcánica que se unen en un gran montículo.

A. Diploastrea heliopora. Este coral tiene un aspecto muy distintivo, con coralitos acanalados con forma volcánica que se unen en un gran montículo.

Acropora loripes

B. Acropora loripes. Este coral tiene ramas cortas y breñosas con coralitos relativamente largos y moderadamente espaciados en los costados y las puntas. Esta es en contraste con muchos de sus congéneres, uno de los que pueden ser visto en el fondo de esta foto. Ese coral Acropora (formosa?) tiene ramas largas, con coralitos más pequeños y más próximos en los costados y coralitos relativamente más largos en la punta de la rama.

C. Echinopora mammiformis. Este coral tiene coralitos largos, poco profundos, y surcados de manera particular en una colonia que forma ramas largas o platos lisos (no mostrados).

C. Echinopora mammiformis. Este coral tiene coralitos largos, poco profundos, y surcados de manera particular en una colonia que forma ramas largas o platos lisos (no mostrados).

D. Acropora hyacinthus. (al fondo) Otro coral acropórido, pero con una colonia morfológica muy diferente. Estos corales forman enormes platos de muchas ramitas diminutas y organizadas que se fusionan con el tiempo.

D. Acropora hyacinthus (al fondo). Otro coral acropórido, pero con una colonia morfológica muy diferente. Estos corales forman enormes platos de muchas ramitas diminutas y organizadas que se fusionan con el tiempo.

E. Acropora nobilis. Yet another acroporid coral, which forms long branches and has numerous fine lateral calyces.

E. Acropora nobilis. Aún otro coral acropórido, el cual forma ramas largas y que tiene numerosos coralitos laterales finos. Nota que esta especie es similar, pero no idéntica, al coral azul en el fondo de la foto de la Acropora loripes.

F. Symphillia radians. Los pólipos de este coral no forman coralitos individuales - se funden juntos dentro de cada valle sinuoso de la colonia. Esta morfología de colonia no es extraña, pero los corales que la forman todos no son relacionados cercanamente entre sí.

F. Symphillia radians. Los pólipos de este coral no forman coralitos individuales – se funden juntos dentro de cada valle sinuoso de la colonia. Esta morfología de colonia no es extraña, pero los corales que la forman todos no son relacionados cercanamente entre sí.

Como puede ver, la morfología del coral es muy diversa. Pero veamos otra vez cómo estos corales se relacionan:

En esta diagrama, relaciones entre especies se muestran como un árbol familiar. Especies que son conectada más directamente con líneas son familiares más cercanos, así que tres especies de Acropora son más cercana entre sí que cualquier de las son a Diploastrea, por ejemplo.

Otra vez, nota que las especies que se conectan con las lineas más cortas son los familiares más cercanos. ¿Habrías adivinado que la Echinopora ramificada estaba más relacionada a la Symphillia y Diploastrea que a la Acropora ramificada?

Mientras paso más tiempo en la isla, me estoy volviendo más confiado en mi habilidad para identificar los corales que necesito para nuestro proyecto. Acelero el ritmo de mi muestrear y realmente estoy tomando el ritmo de la vida de la isla. Más actualizaciones vendrán!*****


*Nota sobre los zapatos de Ryan del futuro: reorientarme a las tierra firme fue muy difícil. ¡En realidad olvidé un par de veces ponerme medias y zapatos antes de caminar en la calle desde mi hostal!

**Desarrollos luego de mi tiempo en la isla probaron que de hecho tener una tonelada de pan extra no es algo malo. Cuando nuestra cuerda de salvamento barcaza decidió, dos días antes de su llegada programada, que: “Eh, no vendremos esta semana!” ‘, los habitantes de LIRS comienzan a acapararse. Los lagartos comienzan a verse deliciosos, y experimentos de la fermentación se intentan con cocos.

***Ryan del futuro ha notado que en realidad, ¡más muestras=más dolores de cabeza a casa organizarlas, guardarlas y procesarlas!

****Sorprendentemente, a pesar de mi amor por Douglas Adams y adhesión general a sus pautas para viajar, este consejo se me escapó el año pasado durante mi viaje a Mo’orea. No es divertido no tener una toalla.

*****Obviamente esto fue una mentira. Otra vez, mala mía.

Diversidad

He llegado a la Estación de Investigación de Lizard Island, y finalmente he comenzado el trabajo de muestreo que me trajo a Australia.

La semana pasada ha sido bastante increíble. Para llegar a la isla, mi compañero de campo y yo volamos en un aeroplano de 5 asientos que contenía solo a nosotros y el piloto. Nunca había estado en un avión tan pequeño, y realmente estaba un poco nerviosa cuando andamos sobre la pista. Esperaba que el vuelo estuviese lleno de baches, pero en realidad fue muy suave — incluso el aterrizaje fue más tranquilo de la mayoría de los que he experimentado.

Hmm.... bien, <em>tal vez</em> valió la pena levantarse tan temprano

Hmm…. bien, tal vez valió la pena levantarse tan temprano

Yo ciertamente <em>no</em> tenía ningunas temas musicales pasando por mi cabeza durante el vuelo. Especialmente ni Indiana Jones ni Jurassic Park.

Yo ciertamente no tenía ningunas temas musicales pasando por mi cabeza durante el vuelo. Especialmente ni Indiana Jones ni Jurassic Park.

Katia window

Landing at Lizard

Desde que he estado aquí, he tenido la oportunidad de asentarme, conocer gente, y comenzar mi búsqueda de corales. La estación y su gente son encantadoras, y el arrecife es también!

Ahora que estoy aquí, debo explicar mi proyecto un poco mejor. Mencioné anteriormente que yo buscaba los microbios normales, o ‘buenos’, en los corales. El problema es, que las especies diferentes de corales tienen ideas diferentes acerca de lo que es bueno para ellos, y las condiciones del medio ambiente pueden cambiar esas ideas incluso dentro de una colonia de coral individual. Por ejemplo, corales que crecen rápido y que viven con luz solar muy fuerte pueden obtener una abundancia de azúcares de sus simbiontes algas, y bacterias que recogen o producen compuestos de proteínas esenciales podrían ser importantes para el coral. Pero los corales en las aguas ligeramente más profundas que no reciben tanto luz solar para la fotosíntesis podrían tener un balance diferente de los requerimientos, y podría ser más beneficioso asociar con otras clases de bacterias. Yo no sé, eso justo improviso – es sola una hipótesis que podría ser interesante de probar en algún momento en el futuro!

Es difícil de probar hipótesis como esa ahora mismo, sin embargo, porque hay factores confusos que complican las cosas. Si comparemos las bacterias de los corales de aguas profundas con las de los corales de aguas poco profundas, probablemente veríamos bastantes diferencias. Pero si los corales de aguas profundas tienen otras cosas en común (por ejemplo, si están todos relacionados unos con otros, o crecen de forma similar), es difícil decir cuales de esas diferencias son en realidad debidas a sus condiciones medioambientales únicas, o si son productos de otros factores.

Para ayudar con este tipo de estudios futuros hipotéticos, planeamos describir el microbioma coral en el contexto de las relaciones de unos con otros en las varias especies. Si un cierto grupo de corales han evolucionado para asociarse con bacterias que otros corales no lo hacen, podemos tomar esto en cuenta cuando nos hagamos otras preguntas, como “Por qué la Especie A contrae más seguido enfermedades en aguas de altas temperaturas que la Especie B?”

En un nivel más básico, sólo queremos describir algo nuevo. Que yo sepa, nadie ha tenido nunca un vistazo a los microbios que se asocian con el coral Galaxea fascicularis. Y quién sabe – tal vez hay alguna bacteria loca en lo que hace a un nuevo tipo de antibiótico y vive en ningún otro lugar! Nunca lo sabremos hasta que nos miramos. Así exploramos la diversidad de microbios en muchas especies de coral que simplemente nunca se han muestreado.

Mi descripción del proyecto probablemente ya no está claro, pero ese es al menos una introducción suficientemente bueno para fluir hacía el que he estado haciendo durante la semana pasada. No puedo muestrear de todos los grupos de corales a menos que sepa como distinguir a uno del otro, así que he estado trabajando en la identificación de las especies. No es tan fácil. He aquí un ejemplo. A continuación, tengo foots (que tomé esta semana) de 5 especies diferentes de coral:

Diploastrea

A

Bushy Acropora

B

C

C

D

D

E

E

F

F

Estos corales son bastante común y los he elegido en realidad porque eran relativamente simple para identificar. Se relacionan uno a otro como así:

Biólogos evolucionistas utilizan el término <strong>clade </strong>para describir grupos de organismo que se relacionan uno a otro más que a cualquier otro organismo. En este diagrama, las tres especies de <em>Acropora </em>forman un clado, como lo hace la combinación de <em>Symphillia</em> y <em>Echinopora</em>, así como la combinación de <em>Symphillia</em>, <em>Echinopora</em>, <strong>y </strong><em>Diploastrea</em>. La combinación de <em>Acropora nobilis </em>y <em>Diploastrea heliopora </em><strong>no </strong>forma un clado, a pesar de que aparecen juntos (la ubicación de los nombres no importa, sólo sus conexiones por líneas). ¿Hace ese claro el diagrama? Forcejeaba ponerlo en palabras, así que dímelo.

Biólogos evolucionistas utilizan el término clade para describir grupos de organismo que se relacionan uno a otro más que a cualquier otro organismo. En este diagrama, las tres especies de Acropora forman un clado, como lo hace la combinación de Symphillia y Echinopora, así como la combinación de SymphilliaEchinoporaDiploastrea. La combinación de Acropora nobilis Diploastrea heliopora no forma un clado, a pesar de que aparecen juntos (la ubicación de los nombres no importa, sólo sus conexiones por líneas). ¿Hace ese claro el diagrama? Forcejeaba ponerlo en palabras, así que dímelo.

De esos corales, esperaríamos que Symphillia Diploastrea tendrían comunidades microbianas más similares entre sí que cualquiera tendría a cualquiera de las especies de Acropora, por ejemplo. Pero ¿puedes adivinar cuáles corales se agrupan juntos justo por manera de mirarlos? Mi tarea es hacer estas evaluaciones para que obtenemos un muen muestra amplia de la diversidad de corales. Pondré las respuestas en mi entrada próxima.


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Sydney

Australia. Famosa por sus desagües que giran hacia atrás, canguros boxeadores, todo lo mortal, y los peces perdidos u olvidadizos, la nación/continente tiene mucho más que eso. Aunque yo he venido aquí para estudiar un aspecto particular de un animal específico, no intento desaprovechar la oportunidad de aprender todo lo que pueda sobre el lugar. Así que, he hecho un poco de exploración.

Visto de aquí esta el Puente del Puerto de Sydney y una silueta parcial de la famosa casa de la ópera durante una recorrida crepuscular en el ferry. Puede ser que las imágenes se enderecen o que no se enderecen automáticamente durante el transporte inter-hemisférico electrónico. (Haz un clic en la imagen para ajustarlo manualmente – la experiencia del usuario puede variar)

El programa que me trajo aquí es el Instituto de Verano de Asia Oriental y del Pacífico (EAPSI). Somos 25 sujetos en Australia en este momento, y muchos de nosotros nos conocimos hace unos meses mientras estábamos en un programa de orientación en Washington, DC. Decidimos que nos llevamos muy bien, así que algunos de nosotros planificamos un corto viaje pre-EAPSI a Sydney juntos para el turismo. Què aprendimos allì? Un ejemplo:

Sidney tiene una "helechería". Hay muchos helechos australianos en esta helechería. Mi familia y yo amamos los helechos; esto es algo que solamente lo descubrí recientemente no fue una característica humana universal. Gracias por un impresionante interés, familia! Quizá un día escribiré una entrada del blog solo sobre los helechos. Podría ser un poema en si mismo. Y gracias por las fotos, Ashley!

Sidney tiene una “helechería”. Hay muchos helechos australianos en esta helechería. Mi familia y yo amamos los helechos; esto es algo que solamente lo descubrí recientemente no fue una característica humana universal. Gracias por un impresionante interés, familia! Quizá un día escribiré una entrada del blog solo sobre los helechos. Podría ser un poema en si mismo. Y gracias por las fotos, Ashley!

La famosa Casa de la Opera de Sydney tiene una "textura" distinctiva que nos lanzó una gran sorpresa cuando la vimos por primera vez. Es un edificio hermoso, pero en todas las fotos que hemos visto, ¿cómo nunca habíamos notado el embaldosado de su superficie?

La famosa Casa de la Opera de Sydney tiene una “textura” distinctiva que nos lanzó una gran sorpresa cuando la vimos por primera vez. Es un edificio hermoso, pero en todas las fotos que hemos visto, ¿cómo nunca habíamos notado el embaldosado de su superficie?

No dejes que nuestras caras felices te engañen; la mayoría de cerveza australiana no está rica. Pero ellos están trabajando en esto (sé que puedo dar fe por un preparado de <a href="http://www.paradoxbeerlab.com/" target="_blank">Paradox Beer Lab</a>). Quizá solamente he convertido quisquilloso mientras viviendo en <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/Brewing_in_Oregon" target="_blank">Oregon, el paraíso por cerveceros</a>. En esta foto hay un gran grupo de gente: <a href="http://dwhite03.web.wesleyan.edu/" target="_blank">el matemático aplicado David White</a>, <a href="http://materials.nuc.berkeley.edu/member/" target="_blank">la ingeniera nuclear Ashley Reichardt</a>, <a href="http://climatology.tamu.edu/" target="_blank">la paleoclimatóloga de corales Kenzie Schoemann</a>, y <a href="http://oregonstate.edu/microbiology/vegathurberlab/ryan-mcminds" target="_blank">moi, el microbiólogo de corales</a>. Sin foto es la fotógrafa, <a href="http://www.zoology.msu.edu/news/176/180/Kateri-Salk-awarded-NSF-grant-to-research-nitrogen-removal-mechanisms-greenhouse-gas-in-seagrass-ecosystems.html" target="_blank">la biogeoquímica Kateri Salk</a> (Gracias por la foto, Kateri!) ¡Echa un vistazo a sus sitios si quieres ser deslumbrado por un puñado de grandes palabras!

No dejes que nuestras caras felices te engañen; la mayoría de cerveza australiana no está rica. Pero ellos están trabajando en esto (sé que puedo dar fe por un preparado de Paradox Beer Lab). Quizá solamente he convertido quisquilloso mientras viviendo en Oregon, el paraíso por cerveceros. En esta foto hay un gran grupo de gente: el matemático aplicado David White, la ingeniera nuclear Ashley Reichardt, la paleoclimatóloga de corales Kenzie Schoemann, y moi, el microbiólogo de corales. Sin foto es la fotógrafa, la biogeoquímica Kateri Salk (Gracias por la foto, Kateri!) ¡Echa un vistazo a sus sitios si quieres ser deslumbrado por un puñado de grandes palabras!

Un par de cosas más: a aceras Australianos llaman ‘pasos de cebras’, que inicialmente me confundió por evocar imágenes de equinos rayados que vagan por la ciudad y pasan en frente de coches. Además, estamos haciendo mal los capuchinos en los Estados Unidos. Un trote matinal a través de la hermosa vecindad de Pyrmont me llevó a un pequeño café italiano donde descubrí el cielo en un taza de café. No puedo explicarte exactamente cuál fue la diferencia, pero alguien necesita descubrirlo. Seriamente.

Por supuesto, como un grupo de investigadores, no tenemos mas remedio que llegar a ser unos nerds un par de veces. La mayoría de nosotros trabajamos con el océano, así que pasamos mucho tiempo en el Acuario Sea Life de Sydney y en el mas pequeño Santuario Sea Life de Manly. Ambos eran fenomenales y me molestaba salir en el propio arrecife. También nos informaron de una de las problemas ambiental más controversial: la matanza de tiburones. Eso es, el programa por el cual el gobierno de Australia mata animales amenazados que son vitales para el ecosistema con el fin de reducir el miedo que la gente tiene para ir a la playa. Podría farfullar sobre esto por un rato, especialmente porque esta política es parte de una tendencia más extensa contra el ambientalismo en Australia, pero por ahora solo referiré a unos cuantos hechos. La matanza de tiburones es mala para el ambiente, y es mala para la economía. Además, ni siquiera es eficaz por la reducción de los ataques de tiburones. Los científicos alrededor del mundo han estado diciendo esto hace años, pero el asunto esta manejado por emociones y política, no por ciencia. Los acuarios en Sydney están tratando de hacer su parte para informar la gente justo tan importantes son los tiburones – si quieres aprender más, no escuche solo a un biólogo de corales; pregunta a los expertosEse enlace te conectará directamente con Southern Fried Science, el blog de un miembro de un laboratorio de tiburones de mi alma mater, la Universidad de Miami. Ellos saben muchísimo mas que yo!

Mientras estábamos en la ciudad, también aprendimos un poco sobre la historia de la ciudad (los detalles en una entrada más tarde), y visité algunos colegas en la Universidad de Tecnología, Sydney. Fue un excelente viaje – uno de mis favoritos hasta el momento. Pero fue sólo el principio de mi aventura Australiana. Mi próxima parada fue la ciudad capital de Canberra. ¡Un resumen de ese viaje está en la agenda de mi entrada próxima!


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