Antes que nada, juega con este mapa interactivo de nuestras ubicaciones de muestreo en nuestra página de inicio del proyecto, porque he estado trabajando en el durante la última semana y estoy muy orgulloso de ello :).

Ahora, tengo que hacer una confesión.

A pesar del enfoque singular de mis entradas anteriores en el blog, mi trabajo no está simplemente basado en la natación en los trópicos. De hecho, la mayoría de los meses del año, puedes encontrarme aquí, dándome un baño en la luz de la pantalla de mi computadora en lugar del agua.

He estado queriendo escribir más mensajes mientras estoy en los Estados Unidos, pero es un poco más difícil “darle vida” al tema. Así que me he quedado fuera. Hoy, sin embargo, creo que tengo un tema interesante que iniciará un nuevo trabajo de entradas relacionando la parte de mi trabajo más interesante y la que consume más tiempo: el trabajo de computadora.

Desde que volvimos de Reunión hace un par de semanas, he gastado una cantidad considerable de tiempo preparando la información y las fotos de nuestros viajes para que estén organizados, útiles y accesibles públicamente. Hasta el momento, el equipo ha recogido más de 3.000 fotografías de más de 500 muestras de coral. Mantener estos organizados puede llegar a ser muy difícil a medida que seguimos progresando, así que he estado trabajando con una variedad de herramientas para hacerlos más fácil. Cuando estamos en el campo, tomamos un montón de fotos de cada coral individual, desde primeros planos que muestran pequeños detalles morfológicos, a fotografías de gran angular que podemos usar más tarde para determinar el entorno del coral. También tomamos fotografías del arrecife, fotografías de unos a otros, y fotografías de esa impresionante criatura que nunca he visto antes y está tan cerca, tan llena de color y taaan chevere y ¡mirar como se alimenta! – está agitando sus antenas alrededor y cogiendo cosas y ¡¡es tan impresionante!!

En serio, esta gamba mantis estaba loco de fresco

Al final del día, tengo cientos de fotos. Algunas son bonitas, algunas necesitan un trabajo de pos-procesamiento para convertirse en bonitas, algunas definitivamente no son bonitas pero pueden ser utilizadas como información, y algunas podrían ser usadas como información con algún pos-procesamiento de los suyos. Cada fotografía puede tener una o múltiples muestras en la misma, o podría ser un gran ejemplo de una enfermedad particular, o tal vez sólo es uno de nosotros poniendo una cara divertida. Para ser útiles, necesito una forma de encontrar estas fotos otra vez, en algún lugar en medio de otras 47,000 fotografías de mi disco duro (en serio).

Ummm… ¿información?

La primera herramienta que uso para gestionar el desorden es Adobe Lightroom. Lightroom me permite procesar mis fotografías en bruto y añadir palabras clave a las fotografías para poder buscarlas fácilmente más tarde. Cuando importo todas las fotos de una inmersión particular, por ejemplo, tengo en Lightroom añadidas automáticamente las coordenadas GPS para la inmersión y palabras clave para el nombre del sitio, proyecto, fotógrafo, etc. Luego voy por la fotografías y añado palabras clave a cada una que incluyen códigos de identificación de muestras y todas las cosas interesantes de la foto, como peces, enfermedades, o buceadores. Ahora, hay dos aspectos muy interesantes de las palabras claves de Lightroom que aprovecho. El primero es que puedes establecer sinónimos de las palabras clave así que cada vez que etiquetas una foto con una palabra, sus sinónimos también serán automáticamente adjuntados. Puedo etiquetar una foto con ‘pez león’, y eso está todo muy bien. Pero más tarde, podría estar pensando de manera científica y quiero buscar todas mis fotografías que contengan ‘Pterois radiata‘. Si tengo previamente dicho a Lightroom que el nombre científico y el nombre común son sinónimos, mi búsqueda encontrará exactamente lo que necesito.

Pero ¿si lo que quiero es encontrar todas las fotos de peces que pertenezcan a los Scorpaeniformes (el grupo que incluye a ambos el pez león y el pez piedra)? El segundo aspecto práctico de las palabras clave de Lightroom llega aquí: pueden ser colocados por jerarquía. He colocado la palabra clave ‘Pterois radiata‘ dentro de ‘Pterois‘, dentro de ‘Scorpaeniformes’, entonces cada vez que etiqueto una foto con el simple término ‘pez león’, es también etiquetada con sus grupos taxonómicos superiores. Para nuestras muestras, incluso puse la palabra clave de la ID de la muestra dentro de sus correspondiente especies. De hecho, he establecido un árbol taxonómico completo de los nombres de los organismos dentro de mis palabras claves, así que cada vez que etiqueto una sencilla muestra con ID, la fotografía está realizando búsquedas con los términos que corresponden a todos los distintos niveles del árbol de la vida. Es immmpresonnnnanteee.

Palabras claves manuales (5): E10.17.Cyp.sera.1.20150628, Bahía Norte, Pulpo, Fotografía de Joe Pollock, Muestra GCMP
Palabras clave que resultan (29): Animal, Antozoo, Australia, Cefalópodo, Cnidaria, Cnidario, Cyphastrea, Cyphastrea serailia, E10.17.Cypsera.1.20150628, GCMP, Muestra GCMP, Coral duro, Hexacoralario, Indo-Pacífico, LH_282, Isla de Lord Howe, Merulinidae, Metazoo, Molusco, Bahía Norte, Pulpo, Océano Pacífico, Fotografía por Joe Pollock, Protóstomo, Robusto, Escleractinio, Coral Pétreo, XVII, AU

El próximo nivel de gestión fotográfica para mí es el pos-procesamiento. No estoy cerca de ser un experto fotógrafo o editor de imagen, pero estoy aprendiendo. Aún es asombroso para mí cuanto puede ser mejorada una fotografía con un par de ajustes rápidos de exposición y niveles. La mayoría de las veces, las fotografías parecen venir de ‘fuera de la cámara’ con una mirada descolorida y de contraste bajo. Las fotografías subacuáticas siempre tienen sus colores desordenados. Cuando tomamos fotografías de muestras, generalmente ponemos una carta de color normal y CoralWatch Coral Health Chart en el encuadre así podemos hacer los ajustes correctos más tarde. Retocando el color y la exposición no sólo hacemos las fotos más bonitas, esto puede ayudarnos a entender los corales. Es difícil detectar manchas de enfermedad o la presencia de blanqueo cuando la fotografía completa tiene varios tonos oscuros de verde. Lo mejor de Lightroom (al menos comparado con Photoshop y algunos otros programas de edición de imágenes)* es la capacidad de hacer ajustes en bruto. A menudo, una serie especial de fotos fueron todas tomadas en condiciones muy similares. Diga, todas las fotos de una única inmersión, donde estuvimos a 30 pies con una cantidad especial de visibilidad y nubosidad. Puedo jugar solo con una de las fotografías, consiguiendo apenas los ajustes correctos, luego simplemente copiar esos ajustes y pegarlos en el resto de las fotografías de la inmersión. ¡Voila! Cientos de fotos editadas.

Antes de los ajustes

Después de los ajustes

Yyyyyy antes

Yyyyyy después

Una vez que tengo editadas y organizadas las fotos, puedo hacer cosas divertidas con ellas, como exportarlas a Flickr para explorarlas plácidamente, o incrustarlas en el mapa que exploraste en el principio de la entrada. Pero explicar eso es para otro día…

*Una nota sobre el software. El siguiente mejor software para fotografía que he usado es gratis de Google (¡gratis!) Picasa. Picasa también te permitirá editar lotes de fotografías, y tenía el reconocimiento facial mucho antes que Lightroom. iPhoto también tiene estas características. Pero hasta donde sé, la palabra clave en Picasa e iPhoto no soporta jerarquías o sinónimos.