¿Dónde dijiste que estuviste?

Registro de expedición. 2 de Marzo de 2015. Universidad Rey Abdullah de Ciencia y tecnología (KAUST), Thuwal, Arabia Saudita.

Después de un agotador viaje de más de 48 horas (incluyendo conducir desde y hacia los aeropuertos, tiempo de vuelo, y escalas), hemos llegado a Arabia Saudita. Me duelen los pies, me duele la espalda, me duele la cabeza, y estoy agotado. En el 2015, nunca debería tomar tanto tiempo llegar realmente a cualquier lugar. Pero nosotros reservamos nuestros vuelos hace sólo una semana; nuestras visas llegaron justo el día antes de que partiéramos. Como resultado del carácter de último minuto de los planes, nuestro itinerario nos hizo parar en San Francisco, Chicago, Frankfurt, y finalmente Jeddah. Hubo tiempo suficiente durante la escala en San Francisco para que David y Justin, los chicos que filman, se encuentren con algunos familiares para cenar afuera del aeropuerto, y tiempo suficiente en Chicago para que todos tomáramos un breve recorrido en auto por la ciudad. Porque yo mismo nunca había estado en Chicago, disfruté a fondo de este tiempo a pesar de la niebla del agotamiento y la ropa maloliente. Pero en este punto, en realidad sólo tengo ganas de una buena noche de sueño.

Registro de expedición. 4 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Pasamos los últimos días recuperándonos de nuestro viaje, conociendo miembros de nuestro laboratorio de acogida, y familiarizándonos con KAUST. Qué lugar fascinante. Una ciudad universitaria entera, construida desde cero en el medio del desierto en sólo un par de años. Los edificios son enormes, monolíticos, incluso monumentales. Estoy viviendo en una casa de estudiantes que me recuerda más a un palacio, con tres pisos, una cama de talla grande y un amplio balcón que me permite disfrutar de la agradable brisa nocturna. Es más que impresionante. Y sin embargo, hay extraños signos de la rápida planificación y construcción. Aceras que no van a ninguna parte, mapas sin etiquetas, pegamento de muy mala calidad que ha llevado a la perdida de los caracteres en la señalización. Si, un lugar extraño.

Registro de expedición. 5 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Hoy fueron nuestros primeros buceos. Qué espectaculares los arrecifes! El tiempo estaba un poco rudo y estuvimos un poco mareados durante los prolongados intentos de anclar, pero una vez que nos metimos al agua, todo se fue. La oleada hacía casi imposible coleccionar muestras, así que por la mayor parte nos conformamos con unos buceos de exploración, recogiendo las vistas y poniéndonos al día sobre los tipos de coral locales. Increíblemente, aunque sólo esperábamos encontrar algo entre 4 y 8 grupos de coral (de un total de más que 21 por todo el mundo), dentro de tres buceos yo había descubierto 12, y espero encontrar al menos uno más. ¡Esos números emulan los que descubrí el año pasado en Australia, y muchos géneros coinciden! ¡Este será un viaje muy productivo!

Registro de expedición. 9 de Marzo de 2015 Algún lugar entre Arabia Saudita y Sudán. Sin tierra a la vista.

Dormimos en el barco en el puerto anoche y salió a los Farasan Banks en la madrugada. Traté de hacer un buceo de muestrear antes del desayuno… y he decidí que en el futuro no trabajaré de nuevo antes de comer. Pero después del primer buceo y un verdadero festín preparado por el tripulación, viajes posteriores bajo la superficie resultó productivo. Visitamos cuatro arrecifes hoy y conseguimos una buen diversidad de muestras de dos de ellos. ¡Empezamos con buen pie!

Registro de expedición. 16 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Después de cinco días de buceo, un día largo explorando Jeddah, y un día preparándonos para los otros tres chicos a salir, ¡estoy agotado! Pasé ayer ponerme al día con trabajo de computadora, y he empezado organizar nuestros metadatos y fotos. Finalmente, tengo algo de tiempo para compartir algunas de las vistas increíbles que hemos estado presenciando en el último par de semanas!


Qué ocupado ha sido este par de semanas. Nunca he estado tan estresado durante la planificación de un viaje – adquirir todos los permisos necesarios para viajar, preparar visas y vuelos y el papeleo – fue una locura! Espero que nunca obtengas un visa para viajar sólo un día antes de tus vuelos. Y ya que Jesse, David, y Justin solamente tenía dos semanas aquí para hacer las cosas, hemos estado empaquetando llenos los días desde entonces. ¡Uf!

Si te estás preguntando porqué estoy en Arabia Saudita, aquí está la respuesta:

Jesse samples at Al Fahal.Aquí hay otra respuesta:

Acropora, Pocillopora, Echinopora.

Oh, y luego está esto:

mind=blown.

El Mar Rojo tiene algunos de los más increíbles arrecifes en el mundo. Rodeado por desierto, hay poca o ninguna escorrentía o la contaminación para arruinar las aguas. Como resultado, la visibilidad es increíble, los colores son alucinante, y los corales son tan felices como podría ser. Lo que es más – son sanos a pesar de que las temperaturas del agua aquí son mucho más altos que los umbrales de blanqueamiento de los arrecifes in cualquier otro lugar en el mundo.

Continuamos el proyecto que empecé el año pasado en Australia, investigando los diferentes microbios que interactúan con corales alrededor del mundo, y decidimos que no podemos generalizar globalmente sobre todos los corales a no ser que incluyéramos los corales de este único medio ambiente. Como puedes ver por mis registros, tuvimos éxito con nuestras colecciones. Ahora, tengo mucho trabajo de laboratorio que hacer – Extracciones de ADN, cultivos de bacterias, y identificaciones de especies de coral usando características esqueléticas microscópicas. ¡Estoy seguro de que será una juerga!

Hola de nuevo (y notas de equipaje para LIRS)

Muy bien, así que fallé miserablemente al mantener este blog mientras estaba en el extranjero. Mala mía. Tú sabes como es – la conexión a Internet está caído por 3-4 días, las entradas escritas anteriormente que tienes listas para salir se suspenden mientras esperas la habilidad para adjuntar fotos, y antes de que lo sepas, te has caído de la furgoneta, tu horario de publicación es irrecuperable, y las distracciones y actividades del trabajo de campo han consumido tu tiempo y atención.

O por lo menos eso es lo que me sucedió a mi.

Afortunadamente para nosotros, esta es una oportunidad para mí de mirar atrás en mi viaje, saboreándolo todo otra vez mientras exploramos digitalmente el arrecife, mientras nos encabezamos hacia los meses del invierno fríos y oscuros del invierno del hemisferio norte. ¡Temblar!

Así que vamos a retomar donde lo dejamos, con un post que escribí pero no publiqué el 3 de agosto, sobre medio camino en mi tiempo en Lizard Island.


Notas de empacar para viajes futuros a Lizard Island:

Cosas para no llevar:

  • Medias. Probablemente piensas ‘¡oh, quizás un par o dos por lo menos!’ pero no. No tragues ningunas medias. Ni zapatos, para esos asuntos. No he llevado ninguno por dos semanas.*
  • Vaqueros. Las noches pueden ser un poco frías, pero la arena se mete en los dobladillos y deja huellas en lugares donde no la quieres. ¡No vale el peso extra!
  • Martillo + cincel. A estos necesito para muestrear mis corales, pero hay abundancia de herramientas en la estación. Desde que estos son realmente pesados y las restricciones de peso para los vuelos a aquí son estrictas, ¡esto fue una gran pérdida de espacio de equipaje!
  • Pan, aparentemente. Por lo menos no tanto como están pensando. Cada uno pide demasiado pan, así que hay una tonelada de sobras en el congelador de “comida gratis”, sobrante de grupos pasados.**

Cosas que podrías olvidar:

  • Chocolate. Y Coca-Cola. Y café. Los pedidos de comida llegan en una barca sólo una vez cada dos semanas, así que si dejas estos fuera de tu pedido, estas frito. Nadie puede ir dos semanas sin café, Coca-Cola, y chocolate.
  • Condimentos. Sí, las personas a menudo también los dejan en el área de comida gratis, pero pueden ser arrebatados rápidamente. ¿Quién quiere una salchicha sin mostaza? Y si puedes traer alguna buena salsa barbacoa americana contigo, serás un éxito en las barbacoas playeras del sábado por la noche. Los “Aussies” no han descifrado éste, se parece… Tampoco han descifrado al “ketchup”. ¿”Salsa de tomate”? ¡Pah!
  • Tu multiherramienta manuable. Sí, debes tener siempre cuidado de ponerla en el equipaje facturado, pero ¡por Dios!, un buen Leatherman es lindo de tener cerca.
  • Un sombrero. Seriamente ¿Por qué no pensaste en traer un sombrero? El sol, ¡se quema!
  • Cables. Lo sé, lo sé, ya revisaste y revisaste por segunda vez para asegurarte que tienes tus cargadores de cámara y de teléfono, tus cables de computadora, y tus adaptadores. Pero aún olvidaste uno; lo garantizo. (La última vez fue el cable de tu ordenador de buceo, y no fuiste capaz de descargar tus reseñas de profundidad y de aire. Estabas muy triste.)
  • Ah, y cosas de ciencia – definitivamente necesitarás más guantes, propinas de pipeta, y bolsitas plásticas estériles (Whirl-Paks) de las que estas pensando. ¿Ese plan que tenías, donde sólo querías 200 muestras? ¡Olvídalo! QUIERES MÁS. ¡Nunca puede tener demasiados muestras!***
  • Y por supuesto, lleva siempre una toalla.****

Ahora, sé que todos ustedes han estado muriendo anticipadamente por las respuestas de identificación de coral de la entrada anterior. Así que aquí estamos:

A. <em>Diploastrea heliopora</em>. Este coral tiene un aspecto muy distintivo, con  <strong title="Estructuras esqueléticas formadas por pólipos de coral individuales">coralitos</strong> acanalados con forma volcánica que se unen en un gran montículo.

A. Diploastrea heliopora. Este coral tiene un aspecto muy distintivo, con coralitos acanalados con forma volcánica que se unen en un gran montículo.

Acropora loripes

B. Acropora loripes. Este coral tiene ramas cortas y breñosas con coralitos relativamente largos y moderadamente espaciados en los costados y las puntas. Esta es en contraste con muchos de sus congéneres, uno de los que pueden ser visto en el fondo de esta foto. Ese coral Acropora (formosa?) tiene ramas largas, con coralitos más pequeños y más próximos en los costados y coralitos relativamente más largos en la punta de la rama.

C. Echinopora mammiformis. Este coral tiene coralitos largos, poco profundos, y surcados de manera particular en una colonia que forma ramas largas o platos lisos (no mostrados).

C. Echinopora mammiformis. Este coral tiene coralitos largos, poco profundos, y surcados de manera particular en una colonia que forma ramas largas o platos lisos (no mostrados).

D. Acropora hyacinthus. (al fondo) Otro coral acropórido, pero con una colonia morfológica muy diferente. Estos corales forman enormes platos de muchas ramitas diminutas y organizadas que se fusionan con el tiempo.

D. Acropora hyacinthus (al fondo). Otro coral acropórido, pero con una colonia morfológica muy diferente. Estos corales forman enormes platos de muchas ramitas diminutas y organizadas que se fusionan con el tiempo.

E. Acropora nobilis. Yet another acroporid coral, which forms long branches and has numerous fine lateral calyces.

E. Acropora nobilis. Aún otro coral acropórido, el cual forma ramas largas y que tiene numerosos coralitos laterales finos. Nota que esta especie es similar, pero no idéntica, al coral azul en el fondo de la foto de la Acropora loripes.

F. Symphillia radians. Los pólipos de este coral no forman coralitos individuales - se funden juntos dentro de cada valle sinuoso de la colonia. Esta morfología de colonia no es extraña, pero los corales que la forman todos no son relacionados cercanamente entre sí.

F. Symphillia radians. Los pólipos de este coral no forman coralitos individuales – se funden juntos dentro de cada valle sinuoso de la colonia. Esta morfología de colonia no es extraña, pero los corales que la forman todos no son relacionados cercanamente entre sí.

Como puede ver, la morfología del coral es muy diversa. Pero veamos otra vez cómo estos corales se relacionan:

En esta diagrama, relaciones entre especies se muestran como un árbol familiar. Especies que son conectada más directamente con líneas son familiares más cercanos, así que tres especies de Acropora son más cercana entre sí que cualquier de las son a Diploastrea, por ejemplo.

Otra vez, nota que las especies que se conectan con las lineas más cortas son los familiares más cercanos. ¿Habrías adivinado que la Echinopora ramificada estaba más relacionada a la Symphillia y Diploastrea que a la Acropora ramificada?

Mientras paso más tiempo en la isla, me estoy volviendo más confiado en mi habilidad para identificar los corales que necesito para nuestro proyecto. Acelero el ritmo de mi muestrear y realmente estoy tomando el ritmo de la vida de la isla. Más actualizaciones vendrán!*****


*Nota sobre los zapatos de Ryan del futuro: reorientarme a las tierra firme fue muy difícil. ¡En realidad olvidé un par de veces ponerme medias y zapatos antes de caminar en la calle desde mi hostal!

**Desarrollos luego de mi tiempo en la isla probaron que de hecho tener una tonelada de pan extra no es algo malo. Cuando nuestra cuerda de salvamento barcaza decidió, dos días antes de su llegada programada, que: “Eh, no vendremos esta semana!” ‘, los habitantes de LIRS comienzan a acapararse. Los lagartos comienzan a verse deliciosos, y experimentos de la fermentación se intentan con cocos.

***Ryan del futuro ha notado que en realidad, ¡más muestras=más dolores de cabeza a casa organizarlas, guardarlas y procesarlas!

****Sorprendentemente, a pesar de mi amor por Douglas Adams y adhesión general a sus pautas para viajar, este consejo se me escapó el año pasado durante mi viaje a Mo’orea. No es divertido no tener una toalla.

*****Obviamente esto fue una mentira. Otra vez, mala mía.

Diversidad

He llegado a la Estación de Investigación de Lizard Island, y finalmente he comenzado el trabajo de muestreo que me trajo a Australia.

La semana pasada ha sido bastante increíble. Para llegar a la isla, mi compañero de campo y yo volamos en un aeroplano de 5 asientos que contenía solo a nosotros y el piloto. Nunca había estado en un avión tan pequeño, y realmente estaba un poco nerviosa cuando andamos sobre la pista. Esperaba que el vuelo estuviese lleno de baches, pero en realidad fue muy suave — incluso el aterrizaje fue más tranquilo de la mayoría de los que he experimentado.

Hmm.... bien, <em>tal vez</em> valió la pena levantarse tan temprano

Hmm…. bien, tal vez valió la pena levantarse tan temprano

Yo ciertamente <em>no</em> tenía ningunas temas musicales pasando por mi cabeza durante el vuelo. Especialmente ni Indiana Jones ni Jurassic Park.

Yo ciertamente no tenía ningunas temas musicales pasando por mi cabeza durante el vuelo. Especialmente ni Indiana Jones ni Jurassic Park.

Katia window

Landing at Lizard

Desde que he estado aquí, he tenido la oportunidad de asentarme, conocer gente, y comenzar mi búsqueda de corales. La estación y su gente son encantadoras, y el arrecife es también!

Ahora que estoy aquí, debo explicar mi proyecto un poco mejor. Mencioné anteriormente que yo buscaba los microbios normales, o ‘buenos’, en los corales. El problema es, que las especies diferentes de corales tienen ideas diferentes acerca de lo que es bueno para ellos, y las condiciones del medio ambiente pueden cambiar esas ideas incluso dentro de una colonia de coral individual. Por ejemplo, corales que crecen rápido y que viven con luz solar muy fuerte pueden obtener una abundancia de azúcares de sus simbiontes algas, y bacterias que recogen o producen compuestos de proteínas esenciales podrían ser importantes para el coral. Pero los corales en las aguas ligeramente más profundas que no reciben tanto luz solar para la fotosíntesis podrían tener un balance diferente de los requerimientos, y podría ser más beneficioso asociar con otras clases de bacterias. Yo no sé, eso justo improviso – es sola una hipótesis que podría ser interesante de probar en algún momento en el futuro!

Es difícil de probar hipótesis como esa ahora mismo, sin embargo, porque hay factores confusos que complican las cosas. Si comparemos las bacterias de los corales de aguas profundas con las de los corales de aguas poco profundas, probablemente veríamos bastantes diferencias. Pero si los corales de aguas profundas tienen otras cosas en común (por ejemplo, si están todos relacionados unos con otros, o crecen de forma similar), es difícil decir cuales de esas diferencias son en realidad debidas a sus condiciones medioambientales únicas, o si son productos de otros factores.

Para ayudar con este tipo de estudios futuros hipotéticos, planeamos describir el microbioma coral en el contexto de las relaciones de unos con otros en las varias especies. Si un cierto grupo de corales han evolucionado para asociarse con bacterias que otros corales no lo hacen, podemos tomar esto en cuenta cuando nos hagamos otras preguntas, como “Por qué la Especie A contrae más seguido enfermedades en aguas de altas temperaturas que la Especie B?”

En un nivel más básico, sólo queremos describir algo nuevo. Que yo sepa, nadie ha tenido nunca un vistazo a los microbios que se asocian con el coral Galaxea fascicularis. Y quién sabe – tal vez hay alguna bacteria loca en lo que hace a un nuevo tipo de antibiótico y vive en ningún otro lugar! Nunca lo sabremos hasta que nos miramos. Así exploramos la diversidad de microbios en muchas especies de coral que simplemente nunca se han muestreado.

Mi descripción del proyecto probablemente ya no está claro, pero ese es al menos una introducción suficientemente bueno para fluir hacía el que he estado haciendo durante la semana pasada. No puedo muestrear de todos los grupos de corales a menos que sepa como distinguir a uno del otro, así que he estado trabajando en la identificación de las especies. No es tan fácil. He aquí un ejemplo. A continuación, tengo foots (que tomé esta semana) de 5 especies diferentes de coral:

Diploastrea

A

Bushy Acropora

B

C

C

D

D

E

E

F

F

Estos corales son bastante común y los he elegido en realidad porque eran relativamente simple para identificar. Se relacionan uno a otro como así:

Biólogos evolucionistas utilizan el término <strong>clade </strong>para describir grupos de organismo que se relacionan uno a otro más que a cualquier otro organismo. En este diagrama, las tres especies de <em>Acropora </em>forman un clado, como lo hace la combinación de <em>Symphillia</em> y <em>Echinopora</em>, así como la combinación de <em>Symphillia</em>, <em>Echinopora</em>, <strong>y </strong><em>Diploastrea</em>. La combinación de <em>Acropora nobilis </em>y <em>Diploastrea heliopora </em><strong>no </strong>forma un clado, a pesar de que aparecen juntos (la ubicación de los nombres no importa, sólo sus conexiones por líneas). ¿Hace ese claro el diagrama? Forcejeaba ponerlo en palabras, así que dímelo.

Biólogos evolucionistas utilizan el término clade para describir grupos de organismo que se relacionan uno a otro más que a cualquier otro organismo. En este diagrama, las tres especies de Acropora forman un clado, como lo hace la combinación de Symphillia y Echinopora, así como la combinación de SymphilliaEchinoporaDiploastrea. La combinación de Acropora nobilis Diploastrea heliopora no forma un clado, a pesar de que aparecen juntos (la ubicación de los nombres no importa, sólo sus conexiones por líneas). ¿Hace ese claro el diagrama? Forcejeaba ponerlo en palabras, así que dímelo.

De esos corales, esperaríamos que Symphillia Diploastrea tendrían comunidades microbianas más similares entre sí que cualquiera tendría a cualquiera de las especies de Acropora, por ejemplo. Pero ¿puedes adivinar cuáles corales se agrupan juntos justo por manera de mirarlos? Mi tarea es hacer estas evaluaciones para que obtenemos un muen muestra amplia de la diversidad de corales. Pondré las respuestas en mi entrada próxima.


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O, piensas que la gramática puede ser mejor? Dímelo en los comentarios o contribuye a la traducción activa en Duolingo.

Importancia

Mi viaje a Australia es parte de un proyecto más amplio para identificar los “buenos” microbios asociados con los corales. Puede parecer extraño al principio hablar sobre bacterias y virus “buenos”. Nos enferman y estropean nuestra comida, y constantemente estamos intentando deshacernos de ellos con jabón de manos anti bacteriano. Desde que los científicos comenzaron a describirlos, nos hemos enfocado en gran medida en estos microbios “malos”, por razones perfectamente legítimas. Es (relativamente) fácil hacer una asociación entre una enfermedad y la bacteria extraña pero abundante que pulula en una persona enferma. También es natural estudiar como funciona con el fin de detenerla. Por otro lado, las bacterias que solo parecen pasar el rato en las personas sanas no parecen muy interesante. Como resultado, cuando hablamos de microbios, tendemos a olvidar la vasta mayoría de ellos, que no causan enfermedades. Y si ellos no nos dañan, entonces ¿por qué importa siquiera si nos olvidamos de ellos?

La respuesta es que muchos microbios descartados como holgazanes son de hecho miembros obreros de la comunidad conocidos como el holobionte. Este término para la combinación del huésped y todos los microbios asociados reconoce que la fisiología y evolución de todos los miembros de tal comunidad están unidos entre sí de una manera altamente compleja y estable. Sólo recientemente hemos empezado a apreciar justo tan importante que puede ser el microbioma. En varias plantas y animales, ellos producen nutrientes esenciales, ayudan en la digestión de la comida, compiten con los patógenos, interactúan con los sistemas inmune y nervioso, y incluso señalan a procesos del desarrollo. Sin microbios, nosotros los ‘macrobios‘ tendríamos que ser muy diferentes. En retrospectiva, esto no debe ser sorprendente. No hay prácticamente ninguna superficie sobre la Tierra que no esté de manera natural cubierta de vida microbiana, y los organismos más grandes evolucionaron en este contexto. Si una “función” requerida para la vida animal ya se lleva a cabo por los microbios, no hay razón para evolucionar los mecanismos otra vez para hacerla por tu cuenta.

Una bacteria que esta cansada del mal trato que se le dio en el pasado: Helicobacter pylori. Está presente en el tracto digestivo de alrededor de la mitad de las personas en el mundo. Inicialmente conectada con las úlceras estomacales y por consecuencia propuesta para la erradicación, H. pylori es ahora sospechada de conferirnos beneficios por modo de preparando nuestro sistema inmune y reduciendo las enfermedades autoinmunes como el asma. Es posible que los ambientes estériles del mundo desarrollado han llevado a los incrementos de estas enfermedades debido a la pérdida de éste y otros microbios de nuestros cuerpos. No quiere decir que no esté también involucrado en la creación de úlceras. Justo demuestra que hay otros factores involucrados, y la eliminación de las bacterias de nuestras vidas podría tener consecuencias nocivas imprevistas. Piénsalo de esta manera: no puedes coger cáncer de pulmón si no tienes pulmones, pero quiere decir eso que ¿los extirpamos? Imagen de Wikipedia.

¿Como relaciona esto a los corales? Bien, cambios ambientales en la temperatura del agua, niveles de nutrientes, o comunidades de peces pueden llevar a cambios en las funciones a ser realizadas por la comunidad microbiana, y pensamos que esto puede ser parte de la razón por la que estamos viendo aparecer enfermedades extrañas alrededor del mundo. El mejor ejemplo que ya sabemos de él es el fenómeno conocido como el blanqueamiento del coral. Como mencioné en una entrada anterior, los corales forman una asociación íntima con las algas unicelulares que se llaman Symbiodinium. Esta asociación, o simbiosis (por lo tanto el nombre del alga), ha existido por tanto tiempo que la mayoría de los corales simplemente no pueden vivir sin sus algas. Sin embargo, cuando la temperatura del mar de eleva, la escorrentía contamina el agua, o los corales llegan a estresarse de otro modo, las algas son expulsadas a menudo de los tejidos de los corales. Porque la Symbiodinium es en realidad la fuente de la mayoría de los colores de los corales, el tejido del coral se queda blanco, o blanqueado, después de ésta expulsión. En este estado blanqueado, el coral se vuelve aún más estresado, y finalmente muere si la simbiosis no se restablece.

Un coral saludable

Un coral saludable (si ligeramente sedimentado)

Un coral blanquecino

Un coral blanqueado (el mismo individuo, tres meses antes)

El blanqueamiento del coral es un caso interesante de enfermedad causada por la falta de un microbio, y creemos que hay otros casos similares esperando a ser descubiertos. El gran tamaño de las células y de la población de Symbiodinium, más su notoria coloración, hacen su ausencia más perceptible en arrecifes de mala salud. Pero los microbios que estamos buscando son mucho más sutiles. Por alguna razón, ellos se esconden en la multitud. Ningún factor medioambiental cambiará el hecho de que cientos a miles de especies de bacterias se asocien con el coral en cualquier momento dado. Y aunque muchas de ellas son algo transitorio, eso no quiere decir que ellas no estén realizando una función importante. A menudo la bacterias que están casi totalmente sin relación pueden ocupar el mismo papel en una comunidad. Si dos bacterias pueden cada una proporcionar al mismo nutriente o ahuyentar a los mismos patógenos, la falta de sólo una de ellas no afectará a la salud del coral. Así que necesitamos usar algún análisis difícil para desenredar de todo esto. ¡Entraré en los detalles en otro momento para esos valientes lectores!

La primera etapa de esta investigación, aunque, comienza con colecciones de muestra. Y aunque es trabajo difícil y estresante, pienso que soy el hombre para el trabajo!

Alguien tiene que hacerlo

Alguien tiene que hacerlo


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Introducción

Desde hace un par de semanas, he estado en Townsville, Australia, donde soy un invitado del Dr. David Bourne en el Instituto Australiano de Ciencias Marinas (AIMS). Entre AIMS y la cercana Universidad de James Cook (JCU), el área es una de los primeros centros del mundo para las ciencias del mar y de arrecifes de coral, y es de bote en bote de los principales investigadores de las especialidades. Estoy aquí para conocerlos mientras continúo mis estudios, y estoy emocionado por la oportunidad!

Australia

Si entrecierras realmente fuerte los ojos, podrás ser capaz de verme saludando desde Townsville. Mapa hecho con Google Maps Engine Pro, con mas detalles aquí.

Antes de ingresar los detalles de mi investigación y este viaje en particular, un poco de antecedentes podría ser provechoso.

En mi primer entrada, presenté el cnidocito, el mecanismo arpón sub-celular que define el grupo de animales llamado Cnidaria. Pero los cnidarios son interesantes por un buen número de otras razones. Por una cosa, ellos son hermosos, y extremadamente comunes en el océano. Desde las anémonas verdes gigantes en las pozas del Noroeste Pacífico hasta los bellos corales y mortíferas medusas Irukanji en las aguas de Australia, es difícil entrar en el agua sin notar este filo de animales diverso.

Anémonas verdes gigantes (Anthopleura xanthogrammica) llenan las pozas de mi amado estado natal de Oregon.

Anémonas verdes gigantes (Anthopleura xanthogrammica) llenan las pozas de mi amado estado natal de Oregon.

Son también ingenierías de la ecosistema. Es decir, especies como los corales son la irremplazable base que soporta todas las otras especies en su hábitat. Sin los corales, habría mucha menos estructura física en las áreas actualmente ocupadas por los arrecifes. Menos estructura lleva menos diversidad, y menos diversidad es a la misma vez aburrida y mala para la gente, que depende de los arrecifes para los alimentos, el turismo, la protección contra tormentas, el descubrimiento de fármacos, y mas. Además, sin miles de años de crecimiento de coral, muchas islas se habrían hundido completamente bajo el mar.

Corales vivos han producido todos las cuestas, los salientes, las grietas, y las hendiduras que crean un ambiente diverso en esta arrecife de Polinesia Francesa.

Adicionalmente, los cnidarios tienen una biología única y extraña. Entre otras cosas, muchos cnidarios forman un enlace esencial con las algas unicelulares llamadas Symbiodinium. En este enlace, las algas se guardan dentro las células de los cnidarios, donde usan la fotosíntesis para almacenar energía solar en azucares que se comparten con su huésped. A cambio de los azucares, los cnidarios resguardan sus algas y las proveen con bloques de construcción de proteínas.

A pesar de lo maravillosas que son los cnidarios, algunos de ellos están en problemas. Los corales que crean unos de los mas diversos y hermosos hábitats en el mundo se están exterminando por enfermedades, depredación, incremento de la temperatura marina, y la actividad humana. Aunque comprendemos algunas de las causas de la perdida de corales, existen todavía muchas que desconocemos. Después de años de estudio, todavía no hemos identificado los patógenos responsables de muchas enfermedades importantes de corales, y aún no sabemos exactamente por qué parecen que han llegado a ser tan devastadoras sólo recientemente. En este contexto, nuestro laboratorio plantea muchas cuestiones en el área de la microbiología coralina, tal como:

  • ¿Cuáles microbios son responsables de estallidos de enfermedades, y cuáles son sobre todo inofensivos?
  • ¿Hace el incremento de las temperaturas del océano que los corales sean más sensitivos a los patógenos?
  • ¿Cómo se transmiten los patógenos? ¿Por medio de sedimentos o agua? ¿O por medio de vectores como algas, esponjas, y comedores de corales, como peces loro?
  • ¿Que pasa al microbioma de los corales si el ecosistema del arrecife se transforma por sobrepescar o escorrentía agrícola aumentado? ¿Puede la comunidad recuperarse de cualquier cambios dañinos?
  • Cómo interactúan los varios miembros del microbioma entre uno al otro y con sus huéspedes?
Uno de nuestros estudios en los Cayos de la Florida investiga cómo el contacto directo con las algas influye en la microbioma del moco de corales.

Uno de nuestros estudios en los Cayos de la Florida investiga cómo el contacto directo con las algas influye en la microbioma del moco de corales.

Muchos de nuestros proyectos se centran en los virus y las bacterias patógenos, pero el microbioma me interesa aún más desde una perspectiva diferente. Yo quiero buscar los microbios que son buenos para sus huéspedes. Con esa información, nuestras descripciones de cambios del microbioma inducidos por estresores se convierten aún más útil. Trabajo de campo para comenzar una descripción más detallada de la microbioma ‘normal’ de los corales es así uno de los propósitos principales de mi visita a Australia. Para algunos detalles más, echa un vistazo a esta página y vuelve para más, luego. ¡Y no vacila de hacer preguntas!

Mi viaje actual es financiado por la programa Institutos de Verano de Asia Oriental y el Pacífico (EAPSI) un esfuerzo de colaboración entre la Fundación Nacional de Ciencia de los Estados Unidos (NSF) y la Academia Australiana de Ciencias (AAS). Desde que he llegado en el país, he tenido un algo de tiempo para explorar un poco, y fui alojado para una sesión de orientación por AAS en la ciudad capital de Canberra. En un par de semanas, estaré viajando al Estación de Investigación de Lizard Island, y espero tomar algunas buenas fotos mientras allí. Para más detalles sobre las personas que he conocido y las cosas divertidas que he visto y aprendido, vuelve pronto.


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Abstract

Un amigo me dijo una vez que mis juegos de palabras eran hilarantes. Ignorando el sarcasmo con el que dijo esto, decidí que el mundo sería un mejor lugar si se comparta en mi comedia. El resultado es el título de este blog.

Ya que mis chistes son sorprendentemente muy malos y intento ser educativo, supongo que debería explicar mi razonamiento tras “The Cnidae Gritty”. Del griego “knide”, que significa “ortiga”, los cnidocitos son arpones con resortes que ayudan a medusas, corales, anémonas y otros cnidarios a capturar presas y defenderse. Algunos cnidocistos sorprendentemente penetran otras células (como cuando te pica una medusa), mientras otros simplemente enlazan o se pegan a su objetivo. En breve están super chéveres.

Simple estructura de un cnidocito. Para una dramática animación, mira este vídeo (donde usan la palabra nematocisto en lugar de cnidocito – ¡es lo mismo!): http://vimeo.com/37431528

La palabra es más comúnmente pronunciado “nye-dee” [en Inglés], pero si Colbert puede dejar la “t” en “report”, entonces yo pienso que tengo derecha a rimar cnidae con gritty.

Mi relación con los cnidocitos es tangencial. Estoy a punto de terminar mi primer año como estudiante de doctorado estudiando los socios microbianos del animal coral. Mientras yo continúo mi investigación, espero actualizar este blog a menudo con los detalles “nitty gritty” de mi trabajo y cualquier otra cosa que me parece interesante en el mundo de la biología del coral. Actualmente, me estoy preparando para un viaje de tres meses y medio a La Gran Barrera de Coral en Australia, donde tengo algunos planes estupendos de trabajo de campo. Publicaré algunos detalles mas el próximo mes antes de ir. Mientras tanto, puedes ir a mi blog de viaje del verano pasado, cuando fui a Tahiti y Mo’orea para estudiar los virus en el Pacífico Sur. Eso te dará una idea de lo que hace este campo tan interesante, y tengo algunas fotos chéveres de arrecifes también. También puedes ir a la página web de nuestro laboratorio para mas detalles acerca de nuestra investigación y enlaces para nuestros papeles, etc.

Me encantaría ser un algo interactivo con este blog, así que si tienes alguna pregunta, comentario, corrección, o críticas, por favor publicarlos!


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