Un día en la vida

Errrrgggg. Te puedo decir sobre todo el trabajo sordo, monótono, y soporífero del laboratorio, o nos podemos sentar y mirar juntos este vídeo. ¡Recordamos los buenos tiempos de trabajo del campo!

Ese vídeo se produjo por el departamento de medios de Oregon State University. Me complace mucho como resultó. La universidad está usando ése para propósitos publicitarias; sin embargo, los hombres que lo hicieron están usando las experiencias y el metraje para mucho más. Los medios son un aspecto emocionante del GCMP. Hacemos nuestro mejor esfuerzo para abrir nuestros proyecto, datos, y experiencias a colegas y al público, y un parte de nuestros fondos se asigna para la difusión de ideas científicas. A nosotros nos importa este aspecto, así que trabajamos con los hombres de los medios de la universidad para producir varios vídeos como estos, además de algunos artículos en línea y en revistas, y, la más emocionante, una película de largo metraje sobre la disminución de arrecifes de coral y las consecuencias para la personas que se les dependen. He aquí un avance (la mayoría de los metrajes de que es de Lizard Island):

Brevemente mencioné los hombres de los medios David y Justin en una entrada anterior, porque vinieron con nosotros para este viaje a Arabia Saudita. ¡Tenerlos aquí fue estupendo! Nada ayuda para aclarar los propósitos de un proyecto como hablar de él con ‘forasteros’.

Pero seriamente, este trabajo del laboratorio… Para cada día de bucear, he pasado dos en el laboratorio. Y un día ha sido desde ~9:00 a ~23:00 de media. ¡NO RECUERDO ESTE TOMANDO TANTO TIEMPO EN AUSTRALIA!

¿Alguien por favor piense en los mamíferos marinos ?!

Los mamíferos marinos reciben mucha atención en la ciencia popular debido a su carácter carismático. Nuestro laboratorio se centra principalmente en los arrecifes de coral en los cuales los mamíferos marinos a veces pueden ser pasados por alto.

Hola, mi nombre es Stephanie, soy miembro de el laboratorio Vega Thurber y la única estudiante en este laboratorio que decidido colocar los estudios en la microbiología de los mamíferos marinos. Mi compañero de laboratorio, Ryan, ahora esta buceando en el Mar Rojo y trabajando en KAUST. En el cual el se encuentra estudiando la diversidad de corales y la bacteria del coral localizado en el Mar Rojo. Ryan me dice que el mar esta rodeado con delfines pero aun el los esta ignorado. A través de este informe de delfines me entró la curiosidad de que otros mamíferos marinos Ryan pueda estar ignorando en el Mar Rojo.

It’s me Stephanie

Haciendo un poco de investigación, es fácil descubrir que el Mar Rojo es el hogar de muchos mamíferos marinos. Me e sorprendió, sobre todo que era el hogar de el dugongo, cual vaga por todo el Océano Pacífico en el Indo-Oeste. El dugongo pertenece al mismo orden que el manatí pero ha sido el único miembro en su familia, Dugongidae, porque la vaca marina de Steller fue cazado hasta su extinción en el siglo 18. El dugongo en sí no aparece como una especie en peligro para extinción, pero se considera vulnerable. A diferencia de los corales, los dugongos tienen una tendencia de nadar, entonces hace que el conteo de población se dificulte. Una nueva manera de resolver este problema es mediante de la utilización de vehículos aéreos no tripulados, pero esta tecnología aún esta en progreso.

Dugongos vs. manaties Encyclopædia Britannica Online. Retrieved 18 March, 2015, from http://global.britannica.com/EBchecked/media/57538/Features-of-dugongs-and-manatees-compared

A pesar de nuestra incapacidad para contar todos los dugongos mundialmente, la ciencia todavía puede usar modelos matemáticos para predecir los peligros que estos mamíferos puedan encontrar. El dugongo como muchos mamíferos marinos, incluyendo el mamífero más amenazado (la vaquita, una marsopa), se ve amenazada por la sobrepesca. Inicialmente esto sonaba un poco contradictorio para mí, ya que los dugongos son principalmente herbívoros, pero en ocasión se comen deliciosos mariscos. Pero, la sobrepesca afecta dugongos porque conduce a la destrucción de las praderas de pastos marinos, que es donde los dugongos les gusta nadar y comer. Dugongos no son los únicos afectados por la sobrepesca, esto causa problemas ecológicos, sociales y económicos. Una forma de ayudar el problema de la sobrepesca es mediante la compra de productos pesqueros sostenibles, que se hace más fácil mediante el uso de una aplicación de Seafood Watch.

Como mis estudios son concentrado en la microbiología, me gustaría terminar este puesto con un poco mas informe de microbiología. Curiosamente, hay pocos estudios que investigan el microbioma de muchos mamíferos marinos, pero resulta que hay un estudio sobre el intestino dugongo! Que emocionante, no?! La microbiología de el intestino se puede estudiar mediante el examen de heces frescas. En este estudio científico recogieron las heces de los dugongos silvestres y en cautiverio. De las heces del dugongo se extrajo el ADN y utilizaron técnicas de DGGE. Se concluyo que los dugongos cautivos y salvajes tienen diferentes comunidades de bacterias en el intestino. Resulta que dugongos cautivos tienen menos tipos de bacterias, y esto puede ser considerados menos saludable.

Espero que ustedes hayan disfrutado este puesto de mamíferos marinos y esperen algunos más en el futuro.

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El GCMP

Turbinaria stellulata. Familia Dendrophylliidae (“Clad0 II”)[1]

En mi entrada pasada, mencioné que yo estaba continuando el proyecto que empecé el verano pasado en Lizard Island, Australia. Es cierto, pero con mis prisas por publicar una entrada sobre mi viaje actual, me hicieron descuidar algunas actualizaciones importantes. Lo primero y principal: ¡gracias a una beca NSF a través de su programa Dimensions of Biodiversity, nuestro proyecto es oficial y tenemos un nombre! El Proyecto Global del Microbioma Coral, o GCMP. El equipo está compuesto por miembros del Laboratorio Vega Thurber de Oregon State University y el Laboratorio Medina de Penn State University. Además de más dinero y un equipo amplio, los objetivos del proyecto también se han visto ligeramente ampliados. Nuestro objetivo sigue siendo entender cómo los diferente corales han evolucionado para estructurar sus comunidades microbianas, pero, como el nuevo nombre implica, ahora también estudiaremos cómo esas comunidades se diferencian geográficamente en los corales de todo el mundo. Sabemos que los corales que están relacionados entre sí pueden habitar ambientes muy diferentes, por lo que la descripción de los microbios que asocian con sólo un subconjunto de esos ambientes no conseguiría el cuadro completo Por ejemplo, los corales que se ven así:

Porites lobata, Pocillopora verrucosa, Pocillopora …?

se puede encontrar en lugares de tan amplio alcance como las aguas del Pacifico Oriental frías, ricas en nutrientes, y provocadas por afloramiento, las aguas tranquilas de las Islas de la Sociedad en el Pacífico Sur (donde tomé esta foto), y las aguas cristalinas y de manera positiva cálidas del Mar Rojo, desde donde estoy escribiendo esta entrada. .La mayoría de los taxónomos ubican individuos de cada extremo de su rango en la misma especie, pero en algún punto esto es una decisión arbitraria. Hay claras diferencias fisiológicas dentro de las especies de coral que están relacionadas con la geografía. Si transplantas la colonia de Pocillopora damicornis desde Panamá a Arabia Saudita, la elevada temperatura del agua podría casi sin duda causar la blanqueamiento y muerte. Por qué? No sé. Algunos investigadores, tales como los del Laboratorio Meyer de OSU, están tratando de calcular eso por considerar las diferencias genéticas en los corales. Otros sugieren que los corales pueden aclimatarse gradualmente a tales extremos de temperatura. Nosotros pensamos que esas hipótesis son parte de la historia, pero que los microbios que viven con los corales podrían contar otra parte importante. Después de todo, las interacciones con microbios por enfermedad y blanqueamiento son las causas más comunes de muerte de coral. Si comparamos las diferencias en microbios a través de un rango de ambiente de una especie hospedera a las diferencias que se explican por la historia evolutiva del coral, quizá podríamos ser capaces de explicar por qué algunos corales son más tolerantes por variación en el ambiente que otros.

¡Revela sus secretos para mí, oh corales!

Mientras aplazo mi montaña del trabajo de laboratorio en cola, estoy alegremente organizando y editando mis fotos del campo. Hemos fotografiado cada colonia de coral muestreada, esperando usar la colección como una copia de seguridad para los metadatos que hemos colectado simultáneamente. La foto en la parte superior de esta página representa el último coral que muestreamos en este viaje – ¡uno que me hico agitar los puños bajo el agua con entusiasmo! No es una especie particularmente rara, pero Jesse y yo tenía una lista de deseos larga, un corto periodo de tiempo, y un limitado número de arrecifes para explorar. Con el fin de describir los extensos niveles de variación en el microbioma coralino, trataremos de muestrear al menos dos especies de cada familia de coral que nos encontramos, en cada lugar. Después de visitamos varios arrecifes alrededor del mundo, esperamos tener suficientes réplicas de cada familia para describir cómo difieren entre sí. A medida que nuestros tanques de aire lentamente bajan su gas, todavía no habíamos encontrado un representativo de los Dendrophylliidae que tenía simbiontes, aunque ¡sabíamos que existe por aquí en algún lado! Justo cuando lo hube abandonado, descubrí esa roca amarilla. Y sinceramente, la excitación que sentí en ese momento es la razón real por lo que yo hago lo que hago.

El premio es ganado.

El premio es ganado.

¿Dónde dijiste que estuviste?

Registro de expedición. 2 de Marzo de 2015. Universidad Rey Abdullah de Ciencia y tecnología (KAUST), Thuwal, Arabia Saudita.

Después de un agotador viaje de más de 48 horas (incluyendo conducir desde y hacia los aeropuertos, tiempo de vuelo, y escalas), hemos llegado a Arabia Saudita. Me duelen los pies, me duele la espalda, me duele la cabeza, y estoy agotado. En el 2015, nunca debería tomar tanto tiempo llegar realmente a cualquier lugar. Pero nosotros reservamos nuestros vuelos hace sólo una semana; nuestras visas llegaron justo el día antes de que partiéramos. Como resultado del carácter de último minuto de los planes, nuestro itinerario nos hizo parar en San Francisco, Chicago, Frankfurt, y finalmente Jeddah. Hubo tiempo suficiente durante la escala en San Francisco para que David y Justin, los chicos que filman, se encuentren con algunos familiares para cenar afuera del aeropuerto, y tiempo suficiente en Chicago para que todos tomáramos un breve recorrido en auto por la ciudad. Porque yo mismo nunca había estado en Chicago, disfruté a fondo de este tiempo a pesar de la niebla del agotamiento y la ropa maloliente. Pero en este punto, en realidad sólo tengo ganas de una buena noche de sueño.

Registro de expedición. 4 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Pasamos los últimos días recuperándonos de nuestro viaje, conociendo miembros de nuestro laboratorio de acogida, y familiarizándonos con KAUST. Qué lugar fascinante. Una ciudad universitaria entera, construida desde cero en el medio del desierto en sólo un par de años. Los edificios son enormes, monolíticos, incluso monumentales. Estoy viviendo en una casa de estudiantes que me recuerda más a un palacio, con tres pisos, una cama de talla grande y un amplio balcón que me permite disfrutar de la agradable brisa nocturna. Es más que impresionante. Y sin embargo, hay extraños signos de la rápida planificación y construcción. Aceras que no van a ninguna parte, mapas sin etiquetas, pegamento de muy mala calidad que ha llevado a la perdida de los caracteres en la señalización. Si, un lugar extraño.

Registro de expedición. 5 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Hoy fueron nuestros primeros buceos. Qué espectaculares los arrecifes! El tiempo estaba un poco rudo y estuvimos un poco mareados durante los prolongados intentos de anclar, pero una vez que nos metimos al agua, todo se fue. La oleada hacía casi imposible coleccionar muestras, así que por la mayor parte nos conformamos con unos buceos de exploración, recogiendo las vistas y poniéndonos al día sobre los tipos de coral locales. Increíblemente, aunque sólo esperábamos encontrar algo entre 4 y 8 grupos de coral (de un total de más que 21 por todo el mundo), dentro de tres buceos yo había descubierto 12, y espero encontrar al menos uno más. ¡Esos números emulan los que descubrí el año pasado en Australia, y muchos géneros coinciden! ¡Este será un viaje muy productivo!

Registro de expedición. 9 de Marzo de 2015 Algún lugar entre Arabia Saudita y Sudán. Sin tierra a la vista.

Dormimos en el barco en el puerto anoche y salió a los Farasan Banks en la madrugada. Traté de hacer un buceo de muestrear antes del desayuno… y he decidí que en el futuro no trabajaré de nuevo antes de comer. Pero después del primer buceo y un verdadero festín preparado por el tripulación, viajes posteriores bajo la superficie resultó productivo. Visitamos cuatro arrecifes hoy y conseguimos una buen diversidad de muestras de dos de ellos. ¡Empezamos con buen pie!

Registro de expedición. 16 de Marzo de 2015. KAUST, Thuwal, Arabia Saudita.

Después de cinco días de buceo, un día largo explorando Jeddah, y un día preparándonos para los otros tres chicos a salir, ¡estoy agotado! Pasé ayer ponerme al día con trabajo de computadora, y he empezado organizar nuestros metadatos y fotos. Finalmente, tengo algo de tiempo para compartir algunas de las vistas increíbles que hemos estado presenciando en el último par de semanas!


Qué ocupado ha sido este par de semanas. Nunca he estado tan estresado durante la planificación de un viaje – adquirir todos los permisos necesarios para viajar, preparar visas y vuelos y el papeleo – fue una locura! Espero que nunca obtengas un visa para viajar sólo un día antes de tus vuelos. Y ya que Jesse, David, y Justin solamente tenía dos semanas aquí para hacer las cosas, hemos estado empaquetando llenos los días desde entonces. ¡Uf!

Si te estás preguntando porqué estoy en Arabia Saudita, aquí está la respuesta:

Jesse samples at Al Fahal.Aquí hay otra respuesta:

Acropora, Pocillopora, Echinopora.

Oh, y luego está esto:

mind=blown.

El Mar Rojo tiene algunos de los más increíbles arrecifes en el mundo. Rodeado por desierto, hay poca o ninguna escorrentía o la contaminación para arruinar las aguas. Como resultado, la visibilidad es increíble, los colores son alucinante, y los corales son tan felices como podría ser. Lo que es más – son sanos a pesar de que las temperaturas del agua aquí son mucho más altos que los umbrales de blanqueamiento de los arrecifes in cualquier otro lugar en el mundo.

Continuamos el proyecto que empecé el año pasado en Australia, investigando los diferentes microbios que interactúan con corales alrededor del mundo, y decidimos que no podemos generalizar globalmente sobre todos los corales a no ser que incluyéramos los corales de este único medio ambiente. Como puedes ver por mis registros, tuvimos éxito con nuestras colecciones. Ahora, tengo mucho trabajo de laboratorio que hacer – Extracciones de ADN, cultivos de bacterias, y identificaciones de especies de coral usando características esqueléticas microscópicas. ¡Estoy seguro de que será una juerga!